Будьте всегда 120 на 70!

Содержание

причины, симптомы, диагностика (анализ кала и пр.) и лечение с видео

Дисбактериоз — одна из самых распространённых медицинских проблем в наше время. Приём антибиотиков, плохая экология, постоянные стрессы на работе вредно влияют на микрофлору кишечника человека. Но возможен ли дисбактериоз у самых маленьких детей, у новорожденных? Откуда он берётся, когда малыш только родился, и его кишечник ещё не успел почувствовать все испытания современной жизни? Что такое вообще «дисбактериоз»?

Что входит в понятие «дисбактериоз»?

Говоря о дисбактериозе, специалисты, обычно, имеют в виду следующие явления:

  1. Нарушенный микробиоценоз в кишечнике, как качественный, так и количественный.
  2. Наличие в кишечнике тех видов бактерий, которых там не должно быть, и отсутствие нужных микроорганизмов.
  3. Нарушение динамики микроэкологии кишок из-за неправильного функционирования механизма защиты и компенсации.

Если сказать проще, то дисбактериозом называется расстройство нормальной работы кишечника из-за дисбаланса имеющейся в нём микрофлоры.

Впервые о дисбактериозе заговорили в 1916 году. Однако тогда этим термином называли различные виды диспепсии.

Дисбактериоз тем опаснее, чем моложе ребёнок. Это состояние может спровоцировать стойкие нарушения пищеварения, прекращение набора веса, снижение иммунитета к различным инфекциям, физическое отставание в развитии, развитие пищевых аллергий.

Откуда берётся дисбактериоз у новорожденных грудничков?

Находясь внутри материнского организма, плод не принимает пищу и в его кишечнике отсутствуют микроорганизмы, как вредные, так и полезные. Первый контакт с материнской микрофлорой происходит во время рождения, когда ребёнок продвигается по родовым путям. Обычно, среди этих микроорганизмов имеются полезные для человека бифидобактерии, лактобактерии и другая микрофлора, например, кишечная палочка, наличие небольшого количества которой является нормой.

Через объятия малыш получает различные бактерии, что является нормой

Затем начинается грудное вскармливание младенца. Даже при идеальном соблюдении матерью правил гигиены, некоторые бактерии попадают в рот ребёнка, а затем и в желудочно-кишечный тракт. Это тоже нормально.

У здорового ребёнка, который пока не пробовал ничего, кроме материнского молока, почти сто процентов кишечной флоры составляют пробиотики (лакто- и бифидобактерии). Оставшиеся 2–3 процента представляют собой:

  • кишечная палочка,
  • стрептококки,
  • микрококки,
  • энтерококки и т.д.

Эти бактерии в таком небольшом количестве не оказывают никакого действия на состояние здоровья ребёнка — ни полезного, ни вредного.

Проблема с первых дней жизни ребёнка, которого кормят грудью, может возникнуть, если его мать вынуждена принимать антибиотики. Попадая в организм малыша вместе с материнским молоком, антибиотики убивают полезную микрофлору. Однако в этих случаях, обычно, грудное вскармливание приостанавливают.

В первую неделю жизни ребёнок получает множество различных микроорганизмов, в том числе и те, которые можно назвать условно патогенными. Поэтому у него развивается, так называемый, «транзиторный» дисбактериоз. Термин «транзиторный» означает проходящий, временный. Это состояние вызывает у большинства детей следующие симптомы:

  • частые срыгивания,
  • водянистый стул с примесью слизи и пены,
  • зелёный оттенок кала.

Но в течение последующих нескольких дней полезные микроорганизмы вытесняют вредные из кишечника ребёнка, и баланс микрофлоры восстанавливается.

Транзиторный дисбактериоз — это нормальное состояние, поэтому врачи, обычно, не ставят диагноз «дисбактериоз» детям первого месяца жизни.

Наличие транзиторного дисбактериоза можно считать опасным только в следующих случаях:

  1. Длительный приём антибиотиков матерью до рождения и после рождения малыша
  2. Необходимость назначить антибиотики младенцу, например, наличие инфекционного заболевания.
  3. Сильная недоношенность.

Все дети, которые соответствуют этим трём признакам, находятся в группе риска.

Мероприятия, которые могут снизить риск перехода транзиторного дисбактериоза в хроническое состояние:

  1. Раннее прикладывание к материнской груди (в первый час после рождения),
  2. Совместная палата в родильном учреждении для матери и ребёнка,
  3. Только грудное вскармливание в течение, как минимум, месяца после рождения, лучше в течение первого года жизни.

Дети, которые находятся на искусственном вскармливании, болеют дисбактериозом гораздо чаще своих сверстников, которые питаются материнским молоком. Никакие ухищрения производителей молочных смесей для новорожденных не смогли на сегодняшний день помочь создать смесь, полностью заменяющую грудное молоко.

Причины возникновения патологии у младенцев

Говорить о том, что причинами дисбактериоза у детей первого года жизни является только приём антибиотиков и отсутствие грудного вскармливания, будет неправильно. Конечно, антибиотики — это очень важный фактор, но далеко не единственный. Причинами появления этого заболевания, кроме того, являются:

  1. Неправильный образ жизни матери во время беременности, курение, алкоголь и т.д.
  2. Наличие родовых патологий,
  3. Отставание в формировании нормальной моторики кишечника новорожденного,
  4. Диспепсия,
  5. Наличие у ребёнка первичного иммунодефицита,
  6. Респираторные и другие инфекции,
  7. Гормональные и противовоспалительные лекарства, назначенные ребёнку или кормящей матери.
  8. Проведение ребёнку операций в первые дни жизни,
  9. Долгое нахождение ребёнка в условиях стационара,
  10. Несоответствие жилищных, бытовых и психологических условий для пребывания младенца и кормящей матери, стресс,
  11. Неправильное поведение матери, например, перекармливание ребёнка или слишком раннее введение прикорма,
  12. Несоблюдение диеты кормящей матерью,
  13. Анемия, рахит, аллергический дерматит.

Симптомы

Существует два вида дисбактериоза:

  1. Компенсированный — симптомы практически отсутствуют. Выявить дисбактериоз можно только случайно, проходя плановые исследования.
  2. Некомпенсированный — симптомов достаточно много, они сильно влияют на общее самочувствие ребёнка.

Обычно у грудничков при втором виде дисбактериозе наблюдаются следующие симптомы по мере развития заболевания:

  1. Беспокойство и нарушения сна из-за кишечных спазмов. Как правило, ребёнок начинает беспокойно себя вести через полтора часа после кормления,
  2. Вздутый живот, чрезмерное газообразование, урчание в животе,
  3. Частые, обильные срыгивания после еды, иногда рвота, не зависимо от приёма пищи,
  4. Зеленоватый оттенок кала, жидкий стул с пеной и слизью, неприятным запахом гнили,
  5. Иногда, наоборот, случаются сильные запоры, из-за снижения активности кишечника.
  6. Неприятный кислый запах изо рта ребёнка,
  7. Ребёнок плохо набирает вес,
  8. Кожа становится очень сухой, иногда появляется сыпь,
  9. Во рту ребёнка могут появиться язвочки, стоматит.

В течение первого месяца жизни малыш должен прибавить не менее 600 гр. веса, а частота стула должна соответствовать частоте кормлений.

Диагностика заболевания у грудничка

Основными диагностическими мерами при подозрении на дисбактериоз у младенцев являются:

  1. Копрограмма — определение качества переваривания в кишечнике пищи, и выявление воспалительных процессов.
  2. Анализ кала на наличие патогенных бактерий (дизентерийная палочка и т.д.)
  3. Анализ кала, выявляющий баланс нормальной и патогенной микрофлоры и чувствительность к антибиотикам.

В норме у детей первого года жизни в анализе должны полностью отсутствовать патогенные энтеробактерии и золотистый стафилококк, число лактобактерий должно быть не менее 10 в шестой степени, а бифидобактерии не менее чем 10 в девятой степени. Если эти показатели нарушены, возникает повод для более детального обследования ребёнка с целью выявления причины этих нарушений.

Как сдавать кал ребёнка на анализы?

Контейнер для анализов

Для анализа нужно заранее подготовить чистую стеклянную ёмкость, лучше всего купить в аптеке специальный стерильный контейнер. Брать кал лучше всего с утра. Сразу после дефекации нужно чистой палочкой взять от 5 до 10 гр. кала и сразу отнести в лабораторию. Если такой возможности нет, и до сдачи анализа должно пройти несколько часов, тогда материал необходимо поместить в холодильник, но не в морозилку. Иначе результат анализа будет неправильным.

В случаях, когда ребёнок уже принимает какие-либо препараты от дисбактериоза, их приём необходимо прекратить за двое суток перед сдачей очередного анализа.

Лечение

Относительно лечения этого заболевания у медиков нет единодушного мнения. Многие врачи, в том числе и известный педиатр доктор Комаровский, считают, что дисбактериоз не является отдельным заболеванием, а значит лечить его не нужно. Нужно просто соблюдать все рекомендации по питанию и уходу за ребёнком, не перекармливать малыша и лечить не болезни, которые этот дисбактериоз вызвали.

В таких странах как Германия, США, Израиль, диагноз дисбактериоз не ставят вообще.

Однако другие специалисты, наоборот, утверждают, что лечение этого состояния необходимо, особенно у детей.

В комплекс лечебных препаратов входят:

  • бактерофаги,
  • пробиотики,
  • пребиотики.

Бактериофаги — это препараты, которые уничтожают патогенную микрофлору. Они действительны против стафилококка, синегнойной палочки и т.д. Примерами могут быть Бактериофаг, Пиобактериофаг, Секстафаг. Ценность этих препаратов в том, что они не влияют на нормальную микрофлору. Их можно применять с первых дней жизни.

Бактериофаг — средство борьбы с дисбактериозом

Пробиотики — препараты, которые изготавливаются из живых бактерий. Проблема в том, что, проходя через кислотную среду желудка и тонкого кишечника, подавляющее число этих бактерий погибает. Однако врачи довольно часто назначают такие препараты как Бификол, Линекс, Энтерол, Нормазе, Хилак, и есть множество положительных отзывов об этих препаратах от пациентов. Эти лекарства можно принимать с грудного возраста, однако дозы должен регулировать врач.

Хилак форте — популярный пробиотик

Некоторые специалисты говорят о том, что введённые таким образом полезные бактерии нежизнеспособны, и выводятся из организма после прекращения приёма препарата.

Пребиотики — это вещества, которые влияют на ускорение развития собственной полезной микрофлоры. Наиболее популярен среди них Дюфалак, сделанный на основе лактулозы — полисинтетического дисахарида. Лактулоза не распадается в желудке и тонком кишечнике, поэтому попадает в толстый кишечник в неизменном виде и способствует росту бифидо- и лактобактерий. К тому же замечено, что это вещество уничтожает вредные микроорганизмы, например, сальмонеллу.

Дюфалак — препарат, который часто назначают детям

Препарат можно назначать детям грудного возраста для добавления в молоко. Дозы определяются индивидуально.

Диета для мамы и малыша

Желательно, чтобы в первые три месяца жизни ребёнок не принимал никакой пищи, кроме материнского молока, если конечно, врач не назначил иначе.

Первый прикорм должен состоять из яблочного сока (не более 30гр.), затем в 5–6 месяцев можно постепенно вводить фруктовое и овощное пюре и творог. После полугода можно понемногу давать ребёнку каши, печенье, мясное пюре, сухари. О каждом новом продукте, который родители собираются ввести в рацион ребёнка, они должны советоваться с педиатром. При каждой нестандартной реакции на введение прикорма (жидкий стул, сыпь, рвота и т.д.) новый продукт нужно немедленно отменять и советоваться с доктором.

Яблочный сок первый прикорм малыша

Для матерей, дети которых находятся на грудном вскармливании, правильное питание тоже очень важно, особенно, если у ребёнка замечены симптомы дисбактериоза.

Женщина должна питаться полноценно, употреблять в пищу, различные виды нежирного мяса, нежирную рыбу, как речную, так и морскую. Эти продукты должны быть тщательно проварены или запечены в духовке. Нужно есть творог, неострый и несолёный сыр, пить свежие кефир, ряженку и йогурт.

Молочные продукты необходимы для кормящей матери

Из фруктов самыми полезными будут зелёные яблоки. Однако, если у малыша диагностирован дисбактериоз, врач может посоветовать женщине вместо свежих, принимать в пищу печёные яблоки. Из овощей предпочтительны для кормящей матери кабачки, тыква, цветная капуста, варёная морковь, репа, брюква. С осторожностью нужно принимать в пищу помидоры, свёклу, пряные травы, экзотические фрукты.

Экзотические фрукты при кормлении грудью не показаны

Категорически запрещены лук, чеснок, чёрная редька. Нежелательно есть клубнику и землянику, абрикосы и персики. Нельзя есть консервы и копчёности.

Консервы кормящим матерям запрещены

Конечно, во время кормления, как и во время беременности нельзя пить алкогольные напитки, курить, принимать любые лекарства без назначения врача.

Особенности лечения дисбактериоза у детей, которые находятся на искусственном вскармливании

Малышам, которые лишены грудного молока, доктор может назначить специальные адаптированные смеси, с повышенным содержанием лактобактерий, например, кисломолочные смеси. Возможно более ранее введение прикорма в виде кефира и творога. Однако все продукты должны быть приготовлены специально с соблюдением всех технологий, а назначать их должен только педиатр.

Профилактика дисбактериоза у новорождённых и детей грудного возраста

Кормление грудью — лучшая профилактика дисбактериоза

Профилактика должна начинаться ещё до рождения ребёнка. Запланировав беременность, женщина должна пройти все обследования, посетить гинеколога, узнать соответствует ли микрофлора половых органов норме, а если нет, то пройти лечение.

Разумеется, нужно отказаться от всех вредных привычек.

Во время беременности нужно вести здоровый образ жизни, побольше бывать на воздухе, не поспешать людных мероприятий, так как там можно инфицироваться заболеванием, которое потребует приёма антибиотиков.

Если беременная женщина уже заболела, нужно обратиться к квалифицированному врачу, который назначит адекватное лечение. Нельзя принимать лекарства по своему разумению.

С приближением родов нужно постараться выбрать родильное учреждение, где практикуется раннее прикладывание к груди и имеются палаты совместного пребывания мамы и ребёнка.

Надо стараться кормить малыша грудным молоком как можно дольше. Если молока у женщины мало, всё равно нужно прикладывать ребёнка к груди, перед тем как дать ему смесь, так как даже несколько капель материнского молока полезны для профилактики дисбактериоза.

О том, стоит ли лечить дисбактериоз у детей, спорят педиатры во всём мире. Любящим родителям проще всего постараться не допустить появления этого заболевания у своих детей, а для этого нужно соблюдать простые правила и рекомендации врачей.

Похожие статьи:

дисбактериоз у грудничков — 25 рекомендаций на Babyblog.ru

Каким должен быть кал (стул) у новорожденных детей и грудничков. Как свойства кала зависят от питания ребенка? В каком случае изменение характера стула ребенка указывает на болезнь?

На первом году жизни ребенка функции пищеварительной системы еще окончательное не сформированы, в связи с чем, кал (стул) новорожденных детей и детей первого года жизни имеет ряд характерных особенностей. Анализ кала у детей первого года жизни также имеет некоторые особенности, которые важно учитывать при попытке установить диагноз дисбактериоза или нарушения пищеварения. Свойства кала ребенка зависят от питания, которое он получает, поэтому нормальный стул детей, находящихся на грудном вскармливании, сильно отличается от нормального стула детей, получающих искусственное вскармливание.

Особенности анализа кала у новорожденных

Первый кал, который отходит примерно через 8 — 10 часов после рождения ребенка, носит название меконий. Меконий представляет собой слизистую пробку, которая содержит небольшое количество клеток, выстилающих кишечник ребенка, а также мельчайшие капли жира и желто-зеленый пигмент — билирубин. Меконий, как правило, это клейкое густое вещество без запаха, которое имеет вязкую консистенцию и темно-зеленый цвет. Характерный цвет меконию придает пигмент — билирубин, образующийся при распаде эритроцитов (красных кровяных телец) ребенка. Как правило, меконий стерилен, то есть не содержит микробов.

Нормальное отхождение мекония в виде зеленовато-черной слизи в общем количестве до 100г продолжается еще 2-3 суток после рождения.

Какие заболевания выявляют при анализе мекония?

ИссИсследование мекония является важным этапом выявления некоторых врожденных заболеваний пищеварительной системы ребенка. Важным показателем является время отхождения первого мекония (в норме, первая порция мекония выделяется в первые 8-10 часов жизни ребенка). Задержка отхождения мекония более 24 часов после рождения носит название мекониевой непроходимости кишечника и может являться признаком следующих заболеваний:

  1. Муковисцидоз — это наследственное заболевание, которое характеризуется повышенной выработкой густой слизи железами организма (в том числе железами кишечника). Меконий в таком случае становится слишком вязким и не способен выделиться наружу.
  2. Аномалии развития кишечника (зарастание просвета кишечника — атрезия, сужение просвета кишечника — стеноз и т.д.) являются причиной задержки отхождения мекония. Лечение в таких случаях состоит в хирургическом восстановлении проходимости кишечника.

Особенности кала ребенка первого года жизни, находящегося на грудном вскармливании.

При естественном вскармливании ребенок получает с молоком все необходимые питательные вещества, витамины и минералы. Кроме того, материнское молоко содержит ферменты, позволяющие ребенку усваивать максимальное количество питательных веществ из материнского молока.

Частота кала у детей находящихся на грудном вскармливании изменяется с возрастом:

  • В первый месяц до 10-15 раз в сутки
  • В последующие 4-5 месяцев 2-5 раза в сутки
  • После 6 месяцев 1-2 раза в сутки или реже
  • После года 1 раз в сутки или 1 раз в двое суток
Ложный понос

Еще раз обратим внимание читателей на тот факт, что жидкий, частый стул у грудничков, получающих грудное молоко это совершенно нормальное явление. Такой стул не следует рассматривать как понос или признак дисбактериоза. В письмах наших читателей часто встречаются такие выражения как «у ребенка находящегося на грудном вскармливании с самого рождения понос… были предприняты многочисленные попытки лечения, но безрезультатно, при этом анализ кала показывает наличие дисбактериоза». Такую ситуацию можно прокомментировать следующим образом:

Совершенно естественно, что ребенок, который получает только жидкую и легкоперевариваемую пищу выделяет жидкий кал. Примерно такой же стул будет и у совершенно здорового взрослого человека, если он станет питаться только молоком. После введения прикорма жидкий кал грудничка сразу начнет густеть и станет таким же как у взрослых, только после того, как ребенок станет получать точно такую же пищу, что и взрослые.
Тот факт, что у детей первого года жизни часто определяется дисбактериоз можно объяснить тем, микрофлора кишечника формируется достаточно долгое время. Мы не рекомендуем проводить лечение дисбактериоза в тех случаях, когда единственным симптомом предполгаемой болезни является жидкий кал. К лечению стоит прибегать только при наличии явных и тяжелых симптомов дисбактериоза: аллергия, отставание по массе тела, сильное вздутие живота после 6 месяцев.

Ложный запор

В связи с тем, что грудное молоко переваривается и всасывается практически полностью, у некоторых детей после 6 месяцев стул может стать очень редким (1 раз в неделю и реже). Если при этом ребенок чувствует себя нормально, может самостоятельно без плача и беспокойства опорожнить кишечник, следует считать такой график выделения кала нормальным. Никакого лечения от запора в данном случае не требуется.

Также довольно часто, у детей первых месяцев жизни наблюдаются некоторые временные затруднения с выделением кала, что вызывает значительное беспокойство со стороны родителей, которые сразу же начинают активно стимулировать выделение стула у ребенка при помощи клизм, слабительных, газоотводных трубок и даже мыла (!).
В подобных случаях следует обратить внимание на консистенцию стула ребенка: если стул мягкий — никакого лечения проводить не нужно, так как затруднение дефекации, очевидно, связано не с тем, что стул слишком плотный, а с тем, что ребенок пока еще не научился хорошо контролировать работу кишечника. Заметим также, что настойчивые попытки родителей стимулировать дефекацию у ребенка с мягким стулом могут только усугубить проблему, так как они лишают ребенка возможности обучить свой кишечник правильной работе. Использование клизм и слабительных допускается только в качестве средства скорой помощи в случаях, когда ребенок не может вывести плотный кал. Если у ребенка наблюдается хроническое формирование плотного кала и сопутствующие этому затруднения дефекации его следует показать врачу и начать лечение от запора.

Особенности кала ребенка на грудном вскармливании

Кал ребенка, находящегося на естественном (грудном) вскармливании, представляет собой неоформленную массу золотистого или желто-зеленого цвета, с кисловатым запахом. Нередко даже при одном и том же питании матери цвет кала ребенка меняется с желтого на зеленый, что также не должно вызывать беспокойства.
Реакция кала на содержание билирубина в норме у детей положительна вплоть до 6-8 месячного возраста. Билирубин придает калу зеленоватый оттенок, поэтому зеленый стул (кал) у ребенка до 8 месяцев, который не сопровождается другими признаками болезни (температура, кровь в кале, беспопокойство ребенка) не должен вызывать никакого беспокойства и не требует никакого лечения.
У грудных детей после 8 месяцев жизни билирубин в кале практически отсутствует, так как кишечные бактерии превражают его в стеркобилин. До 8-месячного возраста микрофлора кишечника не достаточно сформирована, чтобы полностью превращать билирубин в стеркобилин.

Итак, анализ кала грудничка, находящегося на естественном вскармливании, в норме:

  • кал желто-зеленого цвета, кашеобразный или жидкий
  • положителен на билирубин (до 6-8-месячного возраста)
  • имеет кисловатый запах и слабо-кислую среду (рН = 4,8-5,8)
  • в кале грудничка могут содержаться лейкоциты (клетки крови, предназначенные для борьбы с инфекцией), а также слизь и видимые непереваренные комочки молока
  • флора кишечника полностью не сформирована

Особенности кала ребенка первого года жизни, находящегося на искусственном вскармливании

У здорового грудничка, находящегося на искусственном вскармливании, кал имеет некоторые отличия по сравнению с калом ребенка, получающего материнское молоко:
Цвет кала ребенка находащегося на искусственном вскармливании бледно-желтого или светло-коричневого цвета, имеет неприятный запах и более щелочную реакцию (рН = 6,8-7,5)
Консистенция стула пастообразная (если ребенок получает жидкие смеси) или полутвердая, если ребенок получает твердую пищу
Реакция кала на билирубин также положительна до 6-8 месяцев жизни
При микроскопическом анализе кала ребенка первого года жизни обнаруживаются единичные лейкоциты и небольшое количество слизи.
Кал отходит 1-2 раза в сутки, в большем количестве, чем при естественном вскармливании.

ОсОовные заболевания детей грудного возраста, вызывающие изменения анализа кала:

  1. Целиакия — это заболевание, которое характеризуется недостаточностью специального фермента, способствующего усвоению глютена — вещества, которое содержится в пшеничной муке, овсе, рисе, ржи и ячмене. Заболевание проявляется только при введении ребенку прикорма, содержащего продукты с глютеном (различные злаковые каши, хлеб, печенье). Непереваренный глютен вызывает аллергическую реакцию организма, результатом которой является воспаление кишечника. Симптомами целиакии являются: частый стул (до 10 раз в сутки) светло-желтого цвета, с неприятным запахом, беспокойство ребенка, отсутствие прибавки в весе и др. Анализ кала ребенка при целиакии: кал содержит большое количество жиров (стеаторрея).
  2. Лактазная недостаточность — это заболевание, при котором организм ребенка не вырабатывает в достаточном количестве лактазу — фермент, способствующий усвоению лактозы (углевода грудного молока). Лактазная недостаточность проявляется в первые дни кормления ребенка грудным молоком: стул учащен (до 10 раз в сутки), кал водянистый, имеет кислый запах, ребенок беспокоен, плачет, не прибавляет в весе. В анализе кала определяется большое количество жиров (стеаторрея) и молочной кислоты — вещество, которое образуется из лактозы молока под влиянием микрофлоры кишечника.
  3. Муковисцидоз — это заболевание, передающееся по наследству. При муковисцидозе железы организма вырабатывают вязкий секрет, который затрудняет работу всех органов. При кишечной форме муковисцидоза (преимущественное поражение пищеварительной системы) кал ребенка имеет вязкую консистенцию, сероватый цвет, неприятный запах, из-за наличия жира в кале (стеаторрея) «блестит». Анализ кала ребенка с муковисцидозом выявляет большое количество жиров (стеаторрея), в старшем возрасте при введении прикорма — мышечные волокна (креаторея), соединительную ткань, а также крахмал. Все эти вещества в кале указывают на недостаточность переваривания пищи.
  4. Острый и хронический энтерит — это воспалительное заболевание кишечника, которое, как правило, вызывается кишечной инфекцией. Кал ребенка при остром энтерите полужидкой или жидкой консистенции, содержит много слизи, иногда содержит кровь. При микроскопическом исследовании кала ребенка с острым энтеритом выявляется большое количество лейкоцитов (белых кровяных телец), а также повышенное содержание жира (стеаторрея). При хроническом энтерите у ребенка первого года жизни в стуле обнаруживается повышенное содержание жира, а также важных микроэлементов (кальций, фосфор и др.)

Признаки, симптомы и лечение дисбактериоза кишечника у грудничка

Дисбактериоз у детей до года появляется довольно часто. По статистике более 90% родителей сталкиваются с таким явлением. Тем не менее, дисбактериоз кишечника в этом возрасте нельзя воспринимать как отдельное заболевание – это не патология, а скорее состояние слизистой оболочки желудка, при котором появляются трудности перевариванием пищи. При дисбактериозе у детей появляются классические симптомы несварения пищи, которые пугают родителей. Не стоит в данном случае переживать – не все виды дисбактериоза несут опасность для здоровья, а в большинстве случаев симптомы дисбактериоза можно успешно устранить.

Когда возникает дисбактериоз у грудничка и что это такое

Организм человека содержит в себе как стерильные, так и нестерильные среды. К стерильным, к примеру, относится кровь, а вот нестерильной средой можно по праву назвать кишечник. Впрочем, у новорожденного кишечник тоже стерилен, но уже с первыми днями жизни малыша его начинают населять бактерии.

Большинство бактерий являются дружественными для организма – так, в кишечнике, к примеру, может одновременно существовать более трех сотен различных микроорганизмов. Главными из них являются:

  • бифидобактерии;
  • лактобактерии;
  • энтерококки;
  • стрептококки.

Они не конфликтуют между собой лишь потому, что содержатся в определенном соотношении – балансе. Когда бактерии только лишь начинают попадать в кишечник, они еще не могут уравновеситься в среде. Поэтому первый год жизни малыша идет «борьба за место под солнцем» между различными микроорганизмами. Таким образом, дисбактериоз у грудничка – это нарушение баланса полезных и вредных микроорганизмов при заселении кишечника.

Врачи указывают, что нельзя унифицировать набор микрофлоры – для каждого ребенка он свой и не существует перечня с допустимым количеством тех или иных микроорганизмов. В большинстве случаев состав бактерий будет напоминать папин и мамин набор.

Важно! Сегодня врачи практикуют как можно более раннее совместное пребывание ребенка с родителями, чтобы шел обмен защитными микроорганизмами, необходимыми для нормального функционирования организма ребенка.

Причины дисбактериоза у ребенка на грудном вскармливании

Чтобы понять, как лечить дисбактериоз, необходимо разобраться в причине этого явления, от чего он возникает. Какие факторы способствуют тому, что равновесие микрофлоры нарушается? Медики выделяют несколько таких факторов:

  • незрелость органов пищеварения у ребенка;
  • неправильное питание;
  • инфекции, попавшие в кишечник;
  • нарушение микрофлоры после антибиотиков;
  • неблагоприятная экологическая ситуация.

Все эти факторы в комплексе или каждый по одиночке могут спровоцировать развитие дисбактериоза в период грудного вскармливания.

Разновидности дисбактериоза

Симптомы дисбактериоза не у всех детей проявляются одинаково, поскольку состояние имеет свои виды. Так, врачи выделяют такие виды дисбактериоза:

  1. Компенсированный дисбактериоз – при таком виде нарушений внешние признаки увидеть нельзя. Ребенок будет бодр, весел, у него не болит животик, нет метеоризма и не страдает аппетит. Каловые массы могут иметь нормальную консистенцию, запора или диареи нет. Обнаруживается это состояние случайно, если есть необходимость сдать анализ кала по другой причине.
  2. Некомпенсированный – состояние имеет ярко выраженные симптомы, которые чаще всего и пугают молодых родителей, заставляя говорить о дисбактериозе, как о патологии. Действительно, у ребенка появляются следующие нарушения:
  • жидкий стул с примесью слизи, неприятным запахом, пузырьками, остатками непереваренной пищи;
  • иногда запор;
  • вздутие живота;
  • срыгивание;
  • кожные высыпания;
  • налет на языке;
  • потеря аппетита;
  • вялость и дефицит веса.

Именно эти симптомы заставляют родителей бить тревогу и обращаться к врачу. И это правильно, ведь некоторые заболевания желудочно-кишечного тракта проявляются так, как проявляется дисбактериоз. Поэтому необходимо сдать анализы и провести грамотную дифференциальную диагностику. Ведь даже сыпь при дисбактериозе у грудничка на фоне отсутствия иных симптомов может сигнализировать о нарушении микрофлоры.

Анализы при дисбактериозе

При подозрении на нарушение микрофлоры кишечника анализ кала на дисбактериоз не является показательным. Дело в том, что сделать вывод о дисбактериозе, основываясь лишь на одном анализе каловых масс, нельзя, но этот анализ не является полностью бесполезным. Получив результаты, можно судить о присутствии опасных болезнетворных бактерий, которые также могут спровоцировать симптомы, схожие на дисбактериоз. Так, анализы помогут диагностировать сальмонеллез, дизентерию, но никак не дисбактериоз.

На практике при обращении к врачу малышам обязательно назначают анализ кала, либо копрограмму. Как уже упоминалось, анализ кала помогает увидеть патогенные и условно-патогенные:

  • энтеробактерии;
  • шигеллы;
  • клостридии;
  • грибы;
  • стафилококк;
  • сальмонеллы.

Анализ кала назначается в следующих случаях:

  • боли в животе;
  • неустойчивый стул;
  • чередование запора и диареи;
  • аллергическая реакция или сыпь невыясненного происхождения;
  • подозрение на кишечную инфекцию;
  • если ребенка лечили антибактериальными или гормональными препаратами.

Порядок подготовки и сбора кала для анализа на дисбактериоз

  1. За несколько дней врачи рекомендуют отменить слабительные средства, если такие назначались, а также не вводить препараты ректально. В противном случае результаты могут быть недостоверными.
  2. За 12 часов до сдачи не стоит употреблять антибиотики.
  3. Каловые массы собираются в чистый сухой контейнер или стеклянную емкость. На ней указывается фамилия, имя и возраст ребенка, а также время сбора биоматериала.
  4. Достаточно собрать около 10 мл, чтобы лаборатория могла качественно провести анализ.

Важно! При оценке результатов исследования доктор учитывает все симптомы и жалобы родителей, а также возраст малыша. Если у грудничка есть патогенная микрофлора, будет поставлен соответствующий диагноз, а при ее отсутствии и норме каловых масс доктор сделает вывод о дисбактериозе.

Союз педиатров России – дисбактериоз у ребенка видео

Как лечить дисбактериоз у грудного ребенка

Говорить о лечении дисбактериоза не совсем правильно, вернее было бы сказать о необходимости коррекции микрофлоры. Ведь нормальная микрофлора не провоцирует такие симптомы, а потому при стабилизации показателей и достижения индивидуального равновесного состояния можно говорить, что проблема преодолена.

Для нормализации микрофлоры применяются следующие группы препаратов:

  • пробиотики;
  • бифидобактерии;
  • пребиотики;
  • ферментативные препараты.

Читать подробнее о пробиотиках и пребиотиках для детей

Выбор конкретной группы препаратов основывается на причине нарушения микрофлоры кишечника. Обычно при неинфекционной природе грудничку достаточно таких средств от дисбактериоза, как:

Эти средства произведены с учетом детского возраста основного контингента потребителей, поэтому они бережно относятся к собственной микрофлоре кишечника ребенка.

Мнение некоторых педиатров кардинально противоположно основным рекомендациям по организации по питания и здорового образа жизни ребенка. Медики считают, что дисбактериоз просто нужно перетерпеть. Организм – сложная саморегулирующаяся система, поэтому он сам вполне может побороться с нарушением микрофлоры и вопрос, чем лечить дисбактериоз, уйдет сам по себе через 3-7 дней, когда кишечник восстановится. Основной плюс вышеперечисленных средств – безопасность, поэтому если они не помогут малышу, то уж точно не навредят.

Важно! Для нормализации микрофлоры важно соблюдение немедикаментозных способов помощи маленькому пациенту. Во время дисбактериоза необходимо сохранять грудное вскармливание и не переходить на смеси, даже если маме кажется, что малыш голоден и не наедается. Временная потеря аппетита в таком периоде является нормой.

Самой же маме тоже стоит соблюдать диету – не кушать тяжелую и вредную пищу. Важно соблюдать режим дня, не отказываться от прогулок, нормализовать сон и исключить всевозможные стрессовые факторы.

Видео Доктор Комаровский о дисбактериозе у грудного ребенка

Доктор Комаровский о дисбактериозе у грудничка

Дисбактериоз у ребенка на грудном вскармливании не является синонимом слову отравление, хотя по некоторым симптомам эти состояния похожи, а строгие бабушки при дисбактериозе хмурят брови и укоряют молодых родителей, что они не соблюдали гигиену, как было в их время… Сегодня педиатрические воззрения во многом претерпели изменения, а известный педиатр Евгений Олегович Комаровский является ярым противником слова стерильность, отнюдь не отождествляя его с чистотой. Стерильность и намерение оградить ребенка от внешнего мира больше вредит малышу, поэтому доктор пропагандирует осознанное родительство, когда дисбактериоз не воспринимается, как болезнь, а родители не спешат давать малышу лекарства.

Некрасова Анастасия Михайловна

Врач-педиатр, детский кардиолог

Задать вопрос

Кристина
Здравствуйте, подскажите моему малышу девять месяцев, обнаружила темный налет на языке. Ведёт себя как обычно, не плачет, стул в норме, что может быть такое? Лекарство мне понимаем, пищу не употребляет окрашивающую?

Добрый день, обязательно очный осмотр педиатра.
Как правило, тёмный налет появляется на фоне приёма препаратов железа, но раз вы утверждаете, что ребёнок лекарство не принимает, то он может говорить о проблемах ЖКТ, кандидозе, воспалительные процессах полости рта.

Лера.
Здравствуйте, ребёнку месяц на языке появился налёт зелёного цвета, принимаем от газиков бейби калм,
Что это может быть?

Здравствуйте, появление зеленого налета на языке может появиться в результате приема препарата » Бебикалм», так как содержит эфирные масла, особенно мяту. Советую отменить препарат и обратиться к педиатру для подбора другого препарата.

Альбина.
Здравствуйте!ребенку 2 месяца,какает после того как пропукается,сам не может выдавить каловые массы,такое ощущение,что у него пробка,помогали выпустить Газы газовой трубкой,временами получается какать,чаще всего помогали,неделю назад поставили глицериновую свечку,сейчас жидко какает уже неделю,при этом не теряет в весе и кушает хорошо)стул жидкий с пеной,при этом ребёнок весел и бодр,помогите наладить стул ребёнка,дисбактериоз вызвали эти свечи получается?

Нарушение стула вызвала не свечка. Надо исключить лактазную недостаточность (сдать копрограмму, углеводы в кале).
Если ребёнок на грудном вскармливании оценить ваше питание, если ребёнок на искусственном вскармливании, возможно следует менять смесь.
Кроме того, нужно исключить пищевую аллергию, которая так же проявляется запором с чередованием поноса. Для этого сдайте IgE общий и к белку коровьего молока, эозинофильный катионный белок.
Если вы ребёнку даёте пить воду, уберите её, так как проблемы со стулом могут быть и из-за воды

Дисбактериоз у грудничка на грудном вскармливании: симптомы, лечение

Дисбактериоз у грудничка на грудном вскармливании не является самостоятельным заболеванием: он является следствием нарушения баланса между полезными и болезнетворными микроорганизмами, населяющими кишечник. Диагноз этот ставится примерно половине детей в возрасте до года, причем чаще всего страдают от дисбактериоза груднички, которые родились недоношенными. Естественно, любой диагноз, поставленный малышу, пугает родителей и заставляет их искать информацию об обнаруженном педиатром заболевании. Паниковать не стоит, а вот информация о том, как проявляет себя дисбактериоз и каким образом его следует лечить, лишней не будет.

Что такое дисбактериоз?

Согласно определению, дисбактериоз представляет собой нарушение баланса нормальными и вредоносными микроорганизмами, населяющими кишечник. Из-за дисбактериоза работа ЖКТ существенно затрудняется.

В желудке и двенадцатиперстной кишке в норме микрофлора отсутствует. Однако чем дальше отдел ЖКТ от желудка, тем больше в нем обитает всевозможных бактерий. Кишечник населен лактобактериями, грибками, стафилококками и стрептококками. Бактерии принимают активное участие в пищеварении: стерильный кишечник не был бы способен переваривать пищу. Иногда микрофлору кишечника называют дополнительным органом. И это неудивительно: вес бактерий, которые обитают в кишечнике у взрослого человека, достигает 1,5 кг!

В некоторых случаях баланс микрофлоры нарушается, а патологическое состояние, возникающее в результате этого нарушения, называют дисбактериозом.

Формирование микрофлоры кишечника

Малыш появляется на свет со стерильным кишечником: бактерии в нем отсутствуют. Первая «встреча» с материнской микрофлорой происходит в момент появления ребенка на свет. Проходя по родовым путям, ребенок «получает» микроорганизмы, которые позже заселят его кишечник и станут верными помощниками, способствуя нормальному протеканию пищеварительных процессов.

После того как ребенок родился, мама прикладывает его к груди. В этот момент он получает жидкое молозиво, содержащее вещества, позитивно влияющие на развитие необходимых для нормальной работы ЖКТ бактерий.

В течение недели после родов в кишечник малыша заселяются бактерии, среди которых имеются и патогенные. Однако из-за того, что с молоком матери ребенок получает иммуноглобулин, чувствует он себя превосходно: организм справляется с патогенными микробами, а микрофлора приходит в сбалансированное состояние. Иногда из-за наличия в организме патогенных бактерий в первые дни жизни у ребенка может наблюдаться так называемая транзитная форма дисбактериоза, проявляющаяся в виде колик, срыгиваний и водянистого кала с включениями слизи. Подобное расстройство не требует врачебного вмешательства: достаточно немного подождать, и малыш придет в норму.

К концу первой недели жизни полезные микроорганизмы полностью вытесняют патогенные. В результате самочувствие грудничка приходит в норму.

Окончательно баланс между полезными и вредоносными бактериями устанавливается по достижению ребенком месячного возраста

Причины развития заболевания у грудного младенца

У детей, родившихся раньше срока, а также у слабых малышей может развиться состояние, которое врачи называют первичной формой дисбактериоза. Дисбактериоз у грудничка на грудном вскармливании провоцируют следующие факторы:

  • отказ от кормления малыша грудью и ранний переход на заменители грудного молока;
  • прием мамой, кормящей грудью, антибиотиков или препаратов, в состав которых входят гормоны;
  • заражение кормящей мамы внутрибольничной инфекцией, например, золотистым стафилококком. Стафилококк попадает в грудное молоко и инфицирует кишечник грудничка;
  • злоупотребление каким-либо продуктом для прикорма, например, картофельным пюре;
  • у детей, достигших возраста 10-12 месяцев, причиной дисбактериоза может стать заражение гельминтами;
  • сильный стресс, пережитый ребенком, или его пребывание в неблагоприятных социально-психологических условиях.

Как распознать заболевание?

Обычно наблюдательные мамы и папы быстро замечают, что малыш мучается от неприятных проявлений дисбактериоза и отправляются вместе с ребенком к врачу. Однако важно помнить о том, что диагноз может поставить лишь специалист: самолечение может привести к тому, что симптомы усугубятся еще сильнее.

Педиатры называют такие характерные симптомы дисбактериоза у новорожденного ребенка:

  • сильная вялость и заторможенность;
  • побледнение кожных покровов;
  • появление неприятного гнилостного запаха изо рта;
  • каждое кормление провоцирует колики;
  • пересыхание кожи и появление сыпи;
  • плохой аппетит: сделав несколько глотков молока, ребенок сразу же бросает грудь и начинает плакать. Связано это с особенностями анатомического строения кишечника младенца: если имеются какие-либо патогенные процессы, даже небольшое количество пищи причиняет сильный дискомфорт;
  • стоматит или появление высыпаний на слизистых оболочках ротовой полости;
  • частые срыгивания, тошнота и рвота;
  • наличие в каловых массах пены или слизи — серьезный признак расстройства пищеварения.

Иногда подобная симптоматика наблюдается при введении прикорма. Однако после того, как кишечник малыша адаптируется к новой пище, проявления дисбактериоза исчезают сами по себе, не требуя специального вмешательства.

Проявление дисбактериоза у грудничка может быть в виде целого спектра симптомов, например, диареи, запоров, кожной сыпи и т. д.

Чем опасен дисбактериоз у младенцев?

Интересно, что масштабные исследования дисбактериоза у грудничков начались всего десять лет назад. И далеко не все врачи согласны с существованием такого диагноза: многие полагают, что дисбактериоз нужно просто переждать, и постепенно пищеварение придет в норму. Тем не менее запускать дисбактериоз ни в коем случае нельзя хотя бы потому, что это состояние может заставить малыша надолго отказаться от пищи. В результате ребенка приходится госпитализировать и даже кормить при помощи зонда или внутривенных вливаний. Если же лечение дисбактериоза начато на ранней стадии, справиться с ним можно за несколько недель.

Запущенный дисбактериоз при грудном вскармливании может стать причиной достаточно серьезных проблем:

  • из-за того, что пища не усваивается должным образом, малыш слабеет и хуже развивается;
  • кишечник постоянно раздражен, что в будущем провоцирует развитие опасных заболеваний, например, язвы или гастрита;
  • патогенная микрофлора может распространиться на весь кишечник, в результате чего из пищи не будут всасываться необходимые для развития грудничка белки, жиры и углеводы;
  • из-за дисбактериоза падает иммунитет, в результате чего создается благоприятная среда для развития инфекционных заболеваний.

Каким образом осуществляется диагностика дисбактериоза?

Определить, что у малыша развился дисбактериоз, помогает анализ кала, проводимый в лабораторных условиях. Проводятся следующие исследования:

  • копрограмма. С ее помощью врач может установить, хорошо ли в кишечнике грудничка усваивается пища. Одновременно благодаря копрограмме можно определить, нет ли в кишечнике ребенка воспалительного процесса;
  • бактериальный посев кала. Анализ дает возможность определить соотношение болезнетворной и полезной микрофлоры в кишечнике;
  • посев на дисбактериоз. Выявляет степень сформированности микрофлоры желудочно-кишечного тракта.

Любая ошибка при сборе материала может привести к тому, что диагноз будет поставлен неправильно. Собирать кал нужно, руководствуясь следующими правилами:

  • помойте малыша и наденьте на него чистую пеленку. Желательно отказаться от подгузника;
  • относить кал на анализ нужно сразу после того, как он собран;
  • собирать кал нужно в специальную стерильную емкость, приобрести которую можно в любой аптеке;
  • если в рацион ребенка входят молочные смеси, содержащие пребоитики, нужно отменить их за два-три дня до сдачи кала на анализ.

Для того чтобы анализ дал точные результаты, родители должны позаботиться о том, чтобы собрать его правильно

Нарушения питания и дисбактериоз

Выше было сказано, что дисбактериоз у младенцев может развиваться из-за неправильного подхода родителей к кормлению малыша. Действительно, очень часто причины кроются в следующем:

  • перекорм. Подобная неприятность часто происходит в том случае, если мама кормит ребенка по требованию. Следует помнить, что принимать пищу младенец должен каждые 2,5-3 часа. Если прикладывать ребенка к груди слишком часто, то могут появиться серьезные проблемы с пищеварением. Пища просто не успевает расщепиться полностью, в результате в кишечнике начинаются застойные явления, что и провоцирует нарушение баланса микрофлоры;
  • недокром. Многие дети «ленятся» и не прикладывают усилия, находясь у груди. В результате они выпивают только так называемое «переднее» молоко, не добираясь до «заднего», богатого не только жирами и углеводами, но и ферментами;
  • резкая смена рациона. Если резко отлучить ребенка от груди и перевести на молочные смеси, организм просто не успеет адаптироваться к изменению рациона.

Если дисбактериоз возник из-за кишечной инфекции, то лечение потребует гораздо больших усилий. При этом чем младше ребенок, тем медленнее будет восстанавливаться микрофлора.

Если причина развития дисбактериоза в неправильном питании грудничка, то симптомы исчезнут сами по себе после ликвидации причины патологии

Стадии дисбактериоза

В литературе можно найти описание четырех основных стадий дисбактериоза:

  • первая стадия. В кишечнике преобладают полезные бактерии, а в кале выделяются два вида патогенных микроорганизмов. Можно сказать, что это состояние не является патологией: симптомы, беспокоящие малыша, отсутствуют, а состояние микрофлоры нормализуется само по себе. Вызвать первую стадию может употребление мамой в пищу какого-либо нового продукта;
  • вторая стадия. В кале выделяется равное количество полезной и патогенной микрофлоры. Ребенок мучается от поноса, вздутия живота и метеоризма. Кроме того, снижается скорость прибавления массы тела. Обычно для лечения достаточно пересмотреть питание мамы или отказаться от слишком раннего введения прикорма;
  • третья стадия. В кишечнике доминирует патогенная микрофлора. В большом количестве обнаруживаются протеи, стафилококки, стрептококки и т. д. У малыша наблюдаются боли в животике, понос, в котором заметны частички не до конца переваренной пищи, часто ребенок мучается от тошноты и рвоты. Иногда у младенцев повышается температура тела;
  • четвертая стадия. Эта стадия дисбактериоза считается самой опасной, она доставляет ребенку немало мучений. Патогенная микрофлора практически полностью вытесняет полезную и начинает доминировать в кишечнике ребенка. Симптомы болезни усиливаются, ребенок начинает терять в весе, у него наблюдаются симптомы интоксикации организма, вызванные попаданием в кровь продуктов жизнедеятельности болезнетворных бактерий. Нередко на четвертой стадии к симптомам дисбактериоза добавляются одышка, бессонница, астма и т.д.

Лечение дисбактериоза

На ранних стадиях развития дисбактериоз не требует специального лечения: врачи рекомендуют немного подождать, пока организм не придет в норму. Если заболевание доставляет ребенку сильный дискомфорт или дошло до третьей или четвертой стадии развития, может потребоваться прием специальных препаратов: пробиотиков и преботиков.

Пробиотики представляют собой лекарственные средства, в состав которых входят живые бактерии, полезные для человека. Главная задача пробиотиков — нормализовать микрофлору кишечника и вытеснить болезнетворных организмов. Существуют сухие и жидкие пробиотики, в которых содержится либо один штамм бактерий, либо сразу несколько. К самым популярным пробиотикам относятся Бифимбактерин, Лактобактерин, Хилак Форте, Аципол и т. д.

Назначить прием пробиотиков может только врач. Он же подбирает наиболее подходящий препарат, основываясь на результатах лабораторных анализов кала ребенка

Одновременно с пробиотиками назначаются пребиотики, то есть препараты, в состав которых входят вещества, которые стимулируют размножение полезной микрофлоры. В состав пребиотиков входят белки, жиры, витамины и другие компоненты, которые положительно сказываются на состоянии желудочно-кишечного тракта.

Пробиотики выполняют следующие функции:

  • подавляют рост патогенных бактерий;
  • устраняют метеоризм;
  • способствуют восстановлению поврежденных из-за воспалительного процесса слизистых оболочек желудочно-кишечного тракта;
  • способствуют поддержанию оптимального уровня кислотности желудочного сока;
  • стимулируют иммунную систему.

В аптеках можно приобрести препараты, в состав которых входят и пробиотики, и пребиотики. Такие лекарства оказывают на организм младенца отличное воздействие и помогают быстро избавиться от неприятных симптомов дисбактериоза.

Если у ребенка сильно нарушено пищеварение, могут использоваться ферменты, например, Креон, Панкреатин и т. д.

Наконец, для того, чтобы усилить сопротивляемость организма, рекомендованы витаминные препараты.

Антибактериальные препараты для нормализации кишечной микрофлоры

На четвертой стадии дисбактериоза может потребоваться применение антибиотиков, которые подавляют развитие патогенной микрофлоры. К сожалению, из-за антибиотиков погибает и полезная микрофлора, поэтому после курса ребенок обязательно должен пить пробиотики и пребиотики.

Обычно антимикробные препараты принимаются курсом продолжительностью 7-10 дней. После лечения необходимо повторно сдать кал на анализ, чтобы убедиться в том, что удалось ликвидировать дисбаланс между необходимой организму микрофлорой и патогенными бактериями.

Ни при каких обстоятельствах нельзя покупать антибиотики самостоятельно: выбрать оптимальную схему лечение дисбактериоза может только лечащий врач!

Дисбактериоз у детей — довольно серьезное нарушение, которое требует немедленного врачебного вмешательства. Конечно, врач может прийти к выводу, что необходимости в лечении нет и состояние стабилизируется само по себе. Внимательно следите за состоянием малыша: это позволит избежать серьезных нарушений пищеварения, которые доставляют немало беспокойства как младенцу, так и его родителям!

Дисбактериоз у грудничка на грудном вскармливании: как лечить

Врачмедик

Поиск

Найти

ВКонтакте

  • Обследования и анализы

    • МРТ

    • Анализ крови

    • Анализ кала

    • Анализ мочи

    • УЗИ

    • Флюорография

  • Здоровье от А до Я

    • Гинекология

    • Ревматология

    • Проктология

    • Онкология

    • Гастроэнтерология

    • Неврология

    • Кардиология

    • Урология

    • Отоларингология

    • Дерматология

Дисбактериоз у грудничков. Как лечить дисбактериоз кишечника у новорожденного

Содержание:

Одной из самых важных проблем, волнующих родителей грудничков, было, есть и будет состояние органов пищеварения малыша. Ничего удивительного — ведь от того, как питается ребенок, от того, как функционирует его кишечник, зависит и развитие, и становление иммунитета, и даже настроение крохи. Малыш сам при малейшем неблагополучии со стороны пищеварения громко сигнализирует об этом, вселяя в своих родителей еще большую тревогу. Так что же стоит за большинством случаев кишечных колик, младенческих запоров, гиповитаминозов и беспокойного поведения?

Кишечник и его «обитатели»

Появившись на свет, ребенок попадает из абсолютно стерильной среды материнского организма в мир, заселенный огромным количеством разнообразных микробов. Он не может оставаться стерильным долгое время. Практически сразу после рождения его организм начинает заселяться представителями микробного мира. Кишечник ребенка частично заселяется микробами еще в процессе родов, когда малыш продвигается по родовым путям матери. После того как в желудок попадает первая порция пищи, кишечник становится средой обитания многих микроорганизмов. Их число постепенно растет и в конце концов становится настолько значительно, что на каждые 3 грамма кала ребенка приходится 1 грамм микробов! Обитание в кишечнике такого количества микробов весьма полезно не только микробам, но и человеку. Такое взаимовыгодное сосуществование человеческого организма и микробов, существующих в его кишечнике, называется симбиозом.

Все микроорганизмы кишечника делятся на две группы. Первая группа называется облигатной флорой. Эти микробы должны присутствовать в кишечнике обязательно. Ее составляют микробы, без которых не может быть ни нормального пищеварения, ни стойкого иммунитета, ни хорошего самочувствия. Это — бифидобактерии, лактобактерии и кишечная палочка. Также в эту группу входят бактерии-сапрофиты, не оказывающие никакого влияния на здоровье человека — ни положительного, ни отрицательного. Это бактероиды и энтерококки. Группа облигатных микроорганизмов самая обширная, она составляет около 97% от общего числа микробов кишечника.

Вторая группа называется факультативной флорой. Ее присутствие в кишечнике не обязательно. Более того, при неблагоприятных условиях, к которым относится снижение иммунитета, инфекции, стресс, травма, погрешности в питании, микробы из этой группы могут стать патогенными (болезнетворными) и, размножившись в большом количестве, вызвать клинические проявления кишечной инфекции. Среди них есть микроорганизмы, именуемые условно патогенными (клостридии, клебсиелы) и микроорганизмы, присутствия которых в кишечнике ребенка в норме быть не должно. Это стафилококки, протей, дрожжевые грибы рода Кандида. Являясь условно патогенными для взрослого человека, для младенца они становятся болезнетворными непременно, то есть, если у взрослого эти микроорганизмы вызовут заболевание I только в определенных случаях, то у ребенка всегда.

Говоря о микробах, обитающих в кишечнике, нельзя не остановиться особо на группе полезных микробов. Это лактобактерии и бифидобактерии, являющиеся защитным фактором номер один. Существуя в кишечнике, они, во-первых, создают там условия, совершенно не подходящие для жизни болезнетворных микробов. Таким образом, они своей жизнедеятельностью обеспечивают защиту кишечника от избыточного роста условно-патогенных и патогенных микроорганизмов. Во-вторых, эти микробы стимулируют выработку иммунной системой ребенка собственных иммуноглобулинов — надежного щита на пути инфекции извне. В-третьих, бифидобактерии и лактобактерии способствуют выработке в кишечнике естественных витаминов, таких, как В6 В12 и фолиевая кислота. В-четвертых, эти микроорганизмы способствуют всасыванию в кишечнике таких важных компонентов пищи, как железо, кальций и витамин D. И, наконец, они стимулируют перистальтику (двигательную функцию) кишечника.

Правильное соотношение числа бактерий в кишечнике очень важно, при его нарушении происходит снижение иммунитета, а значит, повышается риск кишечных инфекций, возникает гиповитаминоз, может развиться анемия из-за недостаточного поступления железа и рахит — из-за дефицита кальция и витамина D. Вот в чем состоит смысл этого симбиоза, вот какую цену платят нам микроорганизмы за честь существовать вместе с нами!

Как формируется микрофлора кишечника?

Итак, ребенок рождается со стерильным кишечником. Соприкосновение с окружающими его в родильном зале предметами становится первым столкновением с микробным миром, отличным от материнского. В родовых путях матери в норме преобладают лактобактерии, бифидобактерии, кишечная палочка. Проходя по родовым путям матери, ребенок инфицируется этими микроорганизмами, и они частично заселяют его кишечник.

Однако этих микробов недостаточно, да и иммунная система новорожденного еще слишком несовершенна, чтобы полноценно противостоять натиску чужеродных микробов. Поэтому в первые минуты жизни младенцев укладывают маме на живот — ее кожа отдает часть своей микрофлоры, защищая ребенка от первичного заселения чужими микробами.

Но еще более важно первое прикладывание к груди. Когда новорожденный младенец берет в ротик материнский сосок, когда в его желудок попадают первые капли молозива, происходит закладка фундамента здоровья ребенка. Молозиво матери является поистине кладезем самых различных защитных факторов, обусловливающих становление как иммунитета, так и кишечной микрофлоры. В молозиве содержатся так называемые бифидогенные факторы, способствующие росту незаменимых бифидобактерии. Попадая в кишечник ребенка в первые два часа его жизни, бифидоргенные факторы создают там условия, благодаря которым бифидобактерии, полученные новорожденным при рождении, не погибают, а, напротив, растут и размножаются, формируя нормальную микрофлору кишечника. Кроме того, в молозиве содержатся иммуноглобулины, вырабатываемые материнским организмом в ответ на те инфекции, которыми она переболела за свою жизнь. Таким образом, малыш получает своеобразную прививку, и этот иммунитет будет защищать его на протяжении всего первого года жизни. Не вызывает никаких сомнений факт, что те младенцы, которые были приложены к груди в первый час жизни, быстрее и благополучнее преодолевают процесс формирования кишечной микрофлоры, у них реже развивается нарушение микробного пейзажа кишечника, они значительно лучше прибавляют в весе.

На протяжении следующих 3-5 дней жизни ребенка происходит нарастающее инфицирование кишечника различными микроорганизмами, среди которых наряду с кишечной палочкой, бифидобактериями, лактобактериями присутствуют и условно патогенные микроорганизмы в достаточно большом количестве. В результате этого на протяжении первой недели после рождения развивается транзиторный (временный, преходящий) дисбактериоз кишечника. Проявляется он в виде неустойчивого водянистого стула, наличия в нем большого количества слизи, зелени, а также спастическими болями в животе, срыгиваниями. Но уже к концу первой недели наступает следующая фаза микробного заселения кишечника, когда бифидобактерии и лактобактерии начинают вытеснять других представителей микробного мира.

Транзиторный дисбактериоз кишечника не является заболеванием и при отсутствии отягощающих факторов (недоношенности, длительного приема антибиотиков, инфекционных заболеваний) благополучно завершается на второй неделе жизни ребенка. Однако для формирования нормальной микрофлоры необходим ряд важнейших условий — раннее (в течение первого часа жизни ребенка) прикладывание к груди, исключительно грудное вскармливание на протяжении первого месяца жизни малыша и, в идеале, совместное пребывание матери с ребенком. При несоблюдении этих условий риск развития истинного дисбактериоза, а вместе с ним и пищевой аллергии, нарушений пищеварения, снижения иммунитета, многократно возрастает.

Дисбактериоз: что беспокоит малыша?

Младенец, в кишечнике которого нарушен количественный и качественный состав микрофлоры, зачастую ведет себя беспокойно, у него нарушается сон из-за болезненных спазмов кишечника, которые носят приступообразный характер и проявляются через 1,5-2 ч. после кормления. Практически всегда это сопровождается вздутием живота вследствие усиленного газообразования, урчанием по ходу кишечника. Вследствие вздутия живота и нарушения продвижения пищи по кишечнику отмечаются срыгивания и рвота. В особенно тяжелых случаях дисбактериоз кишечника сопровождается синдромом мальабсорбции (нарушением всасывания питательных веществ в тонком кишечнике), что проявляется поносом (пенистый кал с кислым или гнилостным запахом) и снижением темпов прибавки массы тела. А поскольку дисбактериоз кишечника — процесс всегда вторичный, развивающийся на фоне какого-то основного неблагополучия в организме ребенка (кишечных инфекций, приема антибиотиков, недоношенности, неправильного вскармливания), то присоединение синдрома мальабсорбции в еще большей степени усугубляет тяжесть течения этого заболевания.

У многих малышей на фоне дисбактериоза развиваются упорные запоры, поскольку при отсутствии нормального числа бифидобактерий не вырабатывается в должном количестве вещество, стимулирующее сократительную активность кишечника.

По своему течению дисбактериоз бывает компенсированный и некомпенсированный.

При компенсированном дисбактериозе кишечника клинических проявлений нет. Ребенок чувствует себя вполне удовлетворительно, и нарушение микробного пейзажа становится случайной находкой, когда анализ кала (кстати, это исследование служить основным лабораторным критерием дисбактериоза) сдают совсем по другому поводу.

Некомпенсированный дисбактериоз сопровождается всеми теми клиническими признаками, о которых говорилось выше. В таких случаях жалоб очень много и вопрос о том, нуждается ребенок в лечении или нет, не поднимается. Родители малыша стремятся как можно скорее провести наиболее эффективный курс лечения, чтобы избавить ребенка от страданий.

Что же касается первого случая, когда жалоб практически нет, малыш хорошо набирает вес, прекрасно или вполне удовлетворительно спит, нет явных проявления аллергии, то родители задают традиционный вопрос: «Зачем лечить ребенка, если его ничего не беспокоит?» У детей более старшего возраста дело так и обстоит — если обнаруживается компенсированный дисбактериоз кишечника, то в лечении он, как правило, не нуждается. Совсем по-другому решается этот вопрос у грудничков — у них дисбактериоз в лечении нуждается в любом случае, потому что у таких маленьких детей компенсация нарушенной микрофлоры кишечника — состояние временное и очень неустойчивое вследствие несовершенства иммунитета. При малейшем нарушении этого равновесия (а его может вызвать и прорезывание зубов, и прививка, и переохлаждение и перевод на искусственное вскармливание, и простая простуда, и даже стресс) дисбактериоз становится некомпенсированным. Именно поэтому любой дисбактериоз у младенцев нуждается в лечении, которое должно быть строго индивидуальным, взвешенным, основанным на лабораторных данных, комплексным.

Лечение и профилактика дисбактериоза

Одним из самых главных моментов в лечении дисбактериоза является грудное вскармливание. Любой ребенок нуждается в материнском молоке как можно дольше на протяжении первого года жизни. Дети же с проявлениями дисбактериоза кишечника — особенно. Как уже говорилось, материнское молозиво содержит множество веществ, способствующих формированию нормальной микрофлоры и защите от условно-патогенных микроорганизмов. Но и зрелое материнское молока не менее ценно с точки зрения профилактики нарушений микрофлоры кишечника. Оно не только обеспечивает оптимальные условия для роста здоровой микрофлоры, но и поддерживает существующее равновесие между бифидобактериями, лактобактериями и кишечной палочкой, помогая осуществлению полноценного пищеварения и предотвращая развитие аллергических реакций.

Однако при невозможности грудного вскармливания нужно отдавать предпочтение адаптированным смесям, обогащенным защитными факторами. Это и кисломолочные смеси; и смеси, содержащие живые бактерии; и смеси, в состав которых входят пребиотики — вещества, помогающие усвоению и размножению здоровой микрофлоры. Все эти смеси можно применять только по назначению врача.

После бактериологического исследования кала и постановки диагноза лечение (коррекция микрофлоры) должно состоять из двух этапов.

Первый этап включает подавление роста условно патогенных микроорганизмов. Достигается это или при помощи специальных иммунопрепаратов (бактериофагов), обладающих способностью поглощать и растворять внутри себя микробные клетки, или при помощи кишечных антисептиков или антибиотиков. Практически всегда при проведении бактериологического исследования кала проводится и определение чувствительности условно патогенных микробов к тому или иному бактериофагу или антибиотику. Безусловно, использование бактериофагов предпочтительнее. Если же по какой-то причине их применение невозможно, то из ряда антибактериальных препаратов необходимо выбирать те, которые, действуя только в просвете кишечника, не попадают в кровь и не оказывают общего воздействия на организм.

Второй этап коррекции микробного пейзажа кишечника преследует цель заселения его здоровой флорой и создания условий, подходящих для ее роста. Наряду с уже упоминавшимися пребиотиками для этого используются пробиотики — препараты, которые содержат живые микроорганизмы, такие, как известные нам бифидобактерии, лактобактерии и кишечная палочка, а также продукты их жизнедеятельности, помогающие им успешно поселиться в кишечнике. Курс лечения назначает в каждом конкретном случае врач. Пребиотики содержат неперевариваемые вещества, которые оказывают благоприятное воздействие на рост здоровой микрофлоры, и активизирует ее. К ним относится лактулоза, олигосахариды, клетчатка. Эти компоненты к тому же стимулируют двигательную функцию кишечника, помогая справиться с запорами.

Так как же предупредить развитие дисбактериоза у малыша? Прежде всего, планируя беременность, будущей маме необходимо провести обследование у гинеколога, чтобы вовремя выявить и вылечить возможные нарушения флоры половых органов. Если беременность уже наступила, то не поздно позаботиться об этом сейчас — в настоящее время достаточно средств, позволяющих проводить такое лечение во время беременности. Необходимо тщательно следить за диетой, избегать приема антибиотиков, вести здоровый во всех отношениях образ жизни. Кроме того, нелишне заранее поинтересоваться в роддоме, практикуют ли в нем совместное пребывание матери и ребенка и как скоро после родов новорожденных прикладывают к груди.

Мамочки будьте спокойней, не впадайте в панику — дисбактериоз достаточно надуманная болезнь, он не так страшен, как звучит.
И если вы кормите грудью, то флора в кишечнике нормальзуется сама.
Единственное что, своё питание должно быть правильным. А так понятно дело, что если вы едите куриные окорочка, а они почти все наколоты антибиотиком, то и малышу может передастся. Отсюда и дисбак.
У моего ребёнка в 3 месяца была сильная сыпь по всему лицу. этто или аллергия или как раз нехватает бифидобактерий. Мы пропили курс бифидумбактерина и сыпь прошла.
Сейчас ребёнку 9 месяцев, с какашками всё в порядке и уже ходит в горшок. ))) На ГВ стул был жидкий 6 раз в день, с введением прикорма стал более плотным 1-2 раза в день.Обычно по утрам сажаю на горшок.

2012-11-02, Vy.Lika

отличная статья! правда, по моему, по послеждним данным ребенок уже не со стерильным рождается кишечником.
пребиотики — очень важно, ибо без питания все наши заливания бифидобактерий в виде кисломолочки и препаратов — ничего не дадут! пробиотики не закрепятся на ПМЖ в кишечнике.
нам кстати недавно рекомендовали ввести кашу с пребиотиками, мы ввели Humana банановую.
мне врач сказал — мама, если сами часто простужаетесь (а я еще молочницу люблю ловить часто…) себе тоже добавляйте во взрослую кашу ложку-другую смеси — помогает восстановить имунитет
так и делаю

2011-01-10, muvi

Ууу, тронутая нами тема уже не раз. И опробованная множеством препаратов. Увы многие действовали не так как им надо было действовать. Благодаря некоторым приходилось клизмы делать во второй и даже(!!!) в третий раз. К тому же у нас ребеночек немного недоношеный, ну и существовал некоторый риск несварения и дополнительных побочных эффектов
Перерыты всевозможные страницы в интернете, попался мне бифиформ из предыдущего сообщения «Лайки». Он отлично гармонировал с нашим малышом и спустя пару суток, прошли и колики и запоры. Теперь он всегда с нами в нашей общей аптечке.

2012-09-26, drs23

Я не совсем согласна с автором. Лечить нужно. Ни в коем случае не запускать и не пускать на самотек, мол не стоит вмешиваться в природу. Какие муки терпит малыш! Сначала тоже пробовали и клизмочки, и компрессы… вся эта «народная» медицина не дает таких результатов. Как то нам совсем плохо стало, скорее в аптеку. Вот там нам и помогли. Женщина советовала пробиотики. Дала нам бифиформ бэби. Результат налицо. Жалею, что с первых дней не стали принимать. не было бы никаких проблем вкорне. И безопасен самое главное, даже для грудничков.

2012-09-12, polina127

И диагноз есть, и болезнь тоже. Хотите убедиться — антибиотиков сильных попейте, а потом когда кишечник начнет с ума сходить- мы Вам сообщим, что это Вам чудиться. Ибо болезни то нет :)))
Неоднократно сталкивалась с этим заболеванием. Проверенный метод лечения — хилак форте. помогает отлично. Правда курс нужно обязательно полностью пропить. У меня дисбактериоз обычно проявляется на югах, поэтому лекарство вожу с собой.

2012-09-07, Barb

Если долго мучатся, то что нибудь получится! Так вот, как то раз мы приехали с дачи ( были на даче 4 дня) и у нас закрепило животик( Клизму делать нам не нравится, но делали. Подруги мне посоветовали бифиформ. Мне стало интересно, что это такое, прочитала пару статей и решила попробовать. Бифиформ бейби, там идет суспензия и пипетка, очень удобная штука. В общем он нам помог, хороший препарат.

2012-04-16, Papaya

прочитала с удовольствием! у нас тоже кстати дисбиоз был по младенчестве, намучились тогда — страх! а все из-за врачихи, которая сказала что он сам пройдет, а он со временем только хуже да хуже становился. в конце концов достало это все, пошла к другому врачу, тот нам хилак-форте назначил курсом, пропили — и все прошло. сейчас иногда его для профилактики пропиваем, проблем с ЖКТ не имеем, ТТТ

2011-01-08, Porina


Всего 23 отзыва Прочитать все отзывы.

Дисбактериоз кишечника у детей — Симптомы и лечение. Тесты на дисбактериоз

Основные симптомы дисбактериоза кишечника у детей

Каждая мама задается вопросом, как распознать болезнь и на какие признаки дисбактериоза следует обратить внимание детям. Ведь ни для кого не секрет, что своевременное лечение заболевания, это самый быстрый способ решения проблемы и выздоровления.

При нарушении качества состава микрофлоры, а также ее количества, обычно наблюдается беспокойное поведение ребенка, нарушение сна из-за спазмов кишечника, которые очень болезненны и имеют приступообразный характер.Часто они появляются через 1,5 — 2 часа после кормления малыша.

В основном боль у ребенка, сопровождающаяся вздутием живота, урчанием и метеоризмом. Также отмечается срыгивание, а иногда и рвота.

В особо тяжелых случаях наблюдаются более тяжелые симптомы, а именно диарея — пенистый стул с характерным гнилостным и кисловатым запахом, а также замедление набора веса. Эти симптомы дисбактериоза у детей указывают на развитие синдрома мальабсорбции — мальабсорбции в тонком кишечнике питательных веществ.Стоит отметить, что, как правило, этот синдром развивается в организме ребенка, находящегося в бедственном положении: недоношенность, нарушение питания, прием антибиотиков, а также кишечные инфекции.

Довольно часто у многих детей на фоне фоновых заболеваний развиваются запоры, так как нормального количества бифидобактерий, которых необходимо продуцировать в необходимом количестве, чтобы стимулировать сократительную деятельность кишечника, нет.

По степени протекания болезни различают компенсированный и некомпенсированный дисбактериоз.

При развитии компенсированного типа заболевания симптомов нет. Ребенок чувствует себя хорошо, и выявить нарушение микрофлоры можно только после сдачи анализа кала, который, как правило, сдают по другим причинам. Но все вышеперечисленные симптомы дисбактериоза у детей характерны для некомпенсированного типа.

Каковы причины дисбактериоза у детей?

Вначале кишечник ребенка бесплоден и происходит заселение, когда он проходит через рождение его материнскими путями.Попадая во внешний мир, малыш тут же «знакомится» одновременно с большим количеством бактерий, которые обитают в воздушном родильном зале, а также на руках, одежде, медицинском персонале и теле матери.

Причины дисбактериоза у детей совершенно разные, из них выделено:

  • прием антибиотиков;
  • после прикрепления новорожденного к груди;
  • резкое отлучение от груди;
  • отсутствие грудного вскармливания;
  • диатез;
  • непереносимость молочного белка;
  • Гипоксико-ишемическое поражение центральной нервной системы ребенка.

Стоит отметить, что у детей старшего возраста причины дисбактериоза могут быть связаны между собой:

  • плохое питание;
  • принимает антибиотики, цитостатики и гормоны;
  • стресс;
  • плохая экология на локациях.

Чем лечат дисбактериоз кишечника у детей

Обычно лечение любого заболевания должно быть комплексным, в том числе и при дисбактериозе. Родителям нужно запастись весом терпения, так как болезнь носит долговременный характер.Добавки следует соблюдать осторожно.

На первом этапе лечения уменьшить количество или полностью избавиться от вредных микроорганизмов, населяющих кишечник ребенка. Для этих целей применяют специфические бактериофаги и кишечные антисептики.

В более тяжелых случаях лечение дисбактериоза у детей проводят с применением антибиотиков в сочетании с сорбентами, связывающими и выводящими бактерии. Для облегчения переваривания пищи и всасывания ребенку назначаются также ферментные препараты.

После этого, по мере того как кишечник освобождается от множества вредоносных микроорганизмов, его заселяют бифидобактерии и лактобактерии, которые являются представителями нормальной флоры. Существуют специальные препараты, ускоряющие и облегчающие процесс, выполняющие функции нормальной микрофлоры, и тем самым создающие максимально благоприятные условия для роста полезных микроорганизмов. Правда, здесь не стоит экспериментировать и лучше оставить их на усмотрение лечащего врача.

Необходимые тесты на бактериальный рост у детей

Для того, чтобы диагностировать нарушения микрофлоры кишечника, необходимо пропустить разрастание каловых бактерий, что поможет определить соотношение нормальных и условно-патогенных микроорганизмов в кишечнике.Обследование на дисбактериоз у детей дает возможность оценить чувствительность микроорганизмов, населяющих кишечник, что в дальнейшем дает возможность определить правильный метод лечения и подобрать препараты.

Перечень необходимых анализов для определения дисбактериоза у детей:

  • Фекальные бактерии разрастания посевов. Требуется утренний кал, вес 5-10 грамм. учтите, что материал для исследования длительное время хранить при комнатной температуре не рекомендуется, так как точно так же не удастся определить микрофлору;
  • Копрограмма

  • — способ, позволяющий определить, какая степень переваривания пищи в кишечнике, а также есть ли признаки воспаления.Сдать анализ можно и вечером при условии, что до сдачи в лабораторию он будет храниться на нижней полке холодильника;
  • определение количества углеводов в кале.

Дисбактериоз кишечника | Здравоохранение «Qsota»

Дисбактериоз — изменение структуры и количественного соотношения микрофлоры, обычно населяющей полые тела, сообщающейся с окружающей средой (например, верхними дыхательными путями, кишечником) и кожей человека.

С активностью микрофлоры связано физиологическое состояние организма и его неспецифические защитные силы. Представители так называемой нормальной микрофлоры, обычно обитающие в кишечнике, верхних дыхательных путях и на коже человека, за счет сильной антагонистической активности защищают эти органы от проникновения и быстрого размножения патогенных и условно-патогенных микроорганизмов и выполняют несколько другие функции.

Дисбактериоз кишечника — большая и малоизученная проблема современной колопроктологии.Как известно, желудочно-кишечный тракт новорожденного стерилен, и уже через несколько часов после рождения начинается его заселение штаммами стрептококков, кишечной палочки и т. Д., Через сутки в кишечнике уже можно обнаружить анаэробные лактобациллы и энтерококки, а также о На 10-й день интенсивно размножаются Bacteroides, и в среднем через месяц устанавливается и стабильный при этом индивидуальный микробный ценоз. В желудке проксимальная часть тонкой кишки в тонкой кишке и толстой кишке очень бедна, тогда как в дистальном отделе подвздошной кишки, особенно в области илеоцекального клапана, состав микрофлоры меняется, и количество микробов резко увеличивается. .В толстой кишке насчитывается 17 семейств, 45 родов и около 500 видов резидентной микрофлоры.

Термин «дисбактериоз» предлагается разделить на «синдром дисбактериоза толстой кишки» и отдельно «синдром кишечного дисбактериоза», и почти важно знать, что различные нарушения баланса микробной флоры кишечника могут приводить к обострению. колита.

При дисбактериозе могут исчезнуть некоторые представители нормальной микрофлоры (бифидобактерии, молочная кислота, Escherichia coli и др.)) и появляются у редко встречающихся микроорганизмов (грибы рода Candida, Staphylococcus, Proteus, Pseudomonas aeruginosa и др.). Отмечаются выраженные локальные воспаления различной степени, а при резком ослаблении сопротивляемости организма может развиться генерализованная форма эндогенной инфекции вплоть до сепсиса. Дисбактериоз является важным звеном в патогенезе ряда заболеваний пищеварительной системы, дыхательных путей и кожи, влияет на течение и исход заболевания и часто требует специального лечения.

Причины

Причин дисбактериоза может быть несколько: это гипо- и ахлоргидрия желудка (особенно при нарушении эвакуации из него), синдром ведущей петли после резекции желудка по Бильрот-2, дивертикулы тощей кишки и двенадцатиперстной кишки, слепая петля. синдром с тонко-толстокишечным анастомозом встык, непроходимость кишечника, хронический панкреатит, иммунодефицитные состояния, необдуманное и бесконтрольное применение антибиотиков, приводящее к гибели значительной части чувствительных к препарату представителей нормальной микрофлоры и размножению устойчивых к это микрофлора, в том числе патогенная и условно-патогенная, расстройства пищевого поведения, алкоголь и др.

Симптомы, клиническое течение

Клинический синдром дисбактериоза развивается из 4 основных симптомов — диареи, стеатореи, похудания и анемии.

Диагностика

В первую очередь необходимо провести эндоскопическое или рентгенологическое исследование всей толстой кишки, чтобы не пропустить полипы, полипы или рак данной локализации. Могут возникать неопластические процессы, часто поражающие толстую кишку, включая боль в животе, нестабильный стул (чередование запоров и диареи), вздутие живота, похудание, анемия — симптомы, по-видимому, указывают на наличие дисбактериоза.

Обычно для диагностики дисбактериоза проводят посев кала на флору. Для более точной диагностики можно использовать другие методы: аспирация содержимого тощей кишки; респираторный тест с углем; тест, определяющий уровень 5% гидроксииндолеуксусной кислоты (5% HIAA) в моче; глюкозно-водородный дыхательный тест; Тесты D-kelasnya и-kelasnya для специальных исследований и определения степени мальабсорбции, связанной с гипопротеинемией.

Дисбактериоз и синдром раздраженного кишечника клинически схожи и часто возникают вместе.В любом случае исследование микробного ценоза толстой кишки у пациентов с синдромом раздраженного кишечника необходимо, при отсутствии условий для проведения квалифицированного бактериологического анализа кала следует проводить лечение бактериальными препаратами.

Лечение

Зоб часто ассоциируется с нарушением перистальтики кишечника, синдромом раздраженного кишечника, психоэмоциональными расстройствами, поэтому во многих случаях лечение дисбактериоза должно быть комплексным. Важными составляющими лечения являются:

  • строгое соблюдение диеты ;
  • нормализация моторики пищеварительного тракта — в нормальном толстом кишечнике снижается на 1 в минуту и ​​длительность волн перистальтики 40-50 секунд, а при нарушении этого ритма (дискинезия, дисритмия) наблюдается замедление или уменьшение частоты , что клинически проявляется, соответственно, запором или диареей;
  • Нормализация кишечной флоры бактериальными препаратами и устранение возможного кишечного застоя .Антибактериальная терапия во многих случаях только усугубляет дисбактериоз, хотя назначение тетрациклинов и других антибиотиков, конечно, строго под контролем чувствительности к ним посевной флоры, широко принято. Об эффективности лечения свидетельствует прекращение диареи;
  • функциональное питание — хороший эффект дает применение спазмолитиков и препаратов осмотического действия;
  • консультация терапевта t — дисбактериоз и синдром раздраженного кишечника выявляется у 10-20% взрослых и отчетливо прослеживается в его взаимоотношениях с психоэмоциональной сферой, т.е.е. с особенностями личности: у 75% пациентов выявлена ​​утомляемость, депрессия, анорексия, канцерофобия и др. Следует помнить, что при обследовании таких пациентов необходимо в первую очередь исключить органическое поражение пищеварительного тракта, провести проксимальную и дистальная эндоскопия, предпочтительно с биопсией, для выполнения микробного ценоза кишечника и копрограммы.

Профилактика дисбактериоза

Профилактика дисбактериоза заключается в объяснении чрезмерного и неконтролируемого использования любых антибактериальных препаратов, а также применения бактериальных препаратов во время и после лечения антибактериальными препаратами, восстановительной терапии и питания ослабленных пациентов.

Цистит: симптомы, причины и лечение

Цистит — это воспаление мочевого пузыря. Воспаление — это место, где часть вашего тела становится раздраженной, красной или опухшей.

В большинстве случаев причиной цистита является инфекция мочевыводящих путей (ИМП). ИМП возникает, когда бактерии попадают в мочевой пузырь или уретру и начинают размножаться.

Это также может произойти с естественными бактериями в организме, которые становятся несбалансированными. Эти бактерии вызывают инфекцию и воспаление.

Цистит не всегда возникает в результате инфекции. Например, некоторые лекарства и средства гигиены также могут вызывать воспаление.

Лечение цистита зависит от его первопричины. В большинстве случаев цистит бывает острым или возникает внезапно. Случаи интерстициального цистита носят хронический или длительный характер.

Цистит может поразить любого, но чаще всего он возникает у женщин.

Симптомы цистита могут включать:

  • частые позывы к мочеиспусканию
  • позывы к мочеиспусканию после опорожнения мочевого пузыря
  • мутная или сильно пахнущая моча
  • низкая температура в сочетании с ИМП
  • кровь в ваша моча
  • боль во время полового акта
  • ощущение давления или переполнения мочевого пузыря
  • спазмы в животе или спине

Если инфекция мочевого пузыря распространяется на ваши почки, это может стать серьезной проблемой для здоровья.В дополнение к перечисленным выше симптомам, симптомы почечной инфекции включают:

  • тошноту
  • рвоту
  • боль в спине или боку
  • озноб

Кроме того, два дополнительных симптома, жар или кровь в моче, отсутствуют. симптомы цистита сами по себе. Однако они могут возникать в сочетании с другими симптомами почечной инфекции.

Немедленно обратитесь за медицинской помощью, если вы подозреваете, что у вас почечная инфекция.

Тип цистита зависит от его причины.Возможные причины цистита:

  • Инфекция мочевыводящих путей (ИМП)
  • прием определенных лекарств
  • облучение
  • постоянное использование катетера
  • раздражающие гигиенические продукты

Цистит может быть острым или интерстициальным. Острый цистит — это внезапно возникший цистит. Интерстициальный цистит (ИК) — это хронический или длительный случай цистита, который поражает несколько слоев ткани мочевого пузыря.

И острый, и интерстициальный цистит имеют ряд возможных причин.Причина цистита определяет тип. Ниже приведены типы цистита:

Бактериальный цистит

Бактериальный цистит возникает, когда бактерии проникают в уретру или мочевой пузырь и вызывают инфекцию. Это также может быть результатом дисбаланса нормально растущих бактерий в организме. Инфекция приводит к циститу или воспалению мочевого пузыря.

Важно лечить инфекцию мочевого пузыря. Если инфекция распространяется по почкам, это может стать серьезной проблемой для здоровья.

Цистит, индуцированный лекарствами

Некоторые лекарства могут вызвать воспаление мочевого пузыря. Лекарства проходят через ваше тело и, в конечном итоге, выходят через мочевыводящую систему. Некоторые лекарства могут вызывать раздражение мочевого пузыря при выходе из организма.

Например, химиотерапевтические препараты циклофосфамид и ифосфамид могут вызывать цистит.

Лучевой цистит

Лучевая терапия используется для уничтожения раковых клеток и уменьшения размеров опухолей, но она также может повредить здоровые клетки и ткани.Лучевая терапия в области таза может вызвать воспаление мочевого пузыря.

Цистит, вызванный инородным телом

Постоянное использование катетера, трубки, используемой для облегчения выхода мочи из мочевого пузыря, может повысить риск бактериальной инфекции и повредить ткани мочевыводящих путей. И бактерии, и поврежденные ткани могут вызывать воспаление.

Химический цистит

Некоторые средства гигиены могут вызвать раздражение мочевого пузыря. Продукты, которые могут вызвать цистит, включают:

  • спермицидных студня
  • использование диафрагмы со спермицидом
  • спреев для женской гигиены
  • химикатов из пузырьковой ванны

Цистит, связанный с другими состояниями

Иногда цистит возникает как симптом другого медицинские условия, такие как:

  • диабет
  • камни в почках
  • ВИЧ
  • увеличенная простата
  • травмы позвоночника

Цистит чаще встречается у женщин из-за их более короткой уретры.Однако риску этого состояния подвержены как мужчины, так и женщины.

Женщины могут подвергаться более высокому риску цистита, если они:

  • сексуально активны
  • беременны
  • используют диафрагмы со спермицидом
  • пережили менопаузу
  • используют раздражающие средства личной гигиены

Мужчины могут быть в повышенный риск цистита, если у них увеличена простата из-за задержки мочи в мочевом пузыре.

Общие для мужчин и женщин факторы риска включают:

  • текущая или недавняя инфекция мочевыводящих путей (ИМП)
  • лучевая терапия
  • химиотерапия
  • использование катетера
  • диабет
  • камни в почках
  • ВИЧ
  • травмы позвоночника
  • нарушение оттока мочи

Существует несколько различных способов диагностики цистита.Ваш врач может попросить образец мочи, чтобы определить причину вашего цистита и проверить наличие ИМП. Ваш врач может также провести цистоскопию или визуализацию, чтобы определить причину ваших симптомов.

Цистоскопия

При цистоскопии врач осматривает мочевой пузырь с помощью тонкой трубки, к которой прикреплены камера и свет. При необходимости врачи могут использовать цистоскоп для взятия биопсии ткани мочевого пузыря. Биопсия — это небольшой образец ткани, используемый для дальнейшего исследования.

Визуализирующий тест

Визуализирующий тест не часто необходим, но он может быть полезен при диагностике цистита.Рентген или ультразвук могут помочь исключить другие причины цистита, такие как структурная проблема или опухоль.

Лекарства

Антибиотики — обычное средство лечения бактериального цистита. Интерстициальный цистит также можно лечить с помощью лекарств. Лечение интерстициального цистита зависит от его причины.

Хирургия

Хирургия может лечить цистит, но это может быть не лучший выбор врача. Это чаще встречается при хронических состояниях. Иногда хирургическое вмешательство может исправить структурную проблему.

Уход на дому

Уход на дому может помочь уменьшить дискомфорт. Распространенные методы:

  • прикладывание грелок к животу или спине
  • безрецептурных обезболивающих, таких как ибупрофен и парацетамол
  • сидячие ванны для очищения области таза

Иногда симптомы цистита можно контролировать дома , без приема лекарств. Они не должны заменять антибиотики, если они необходимы для лечения ИМП. Общие методы домашней терапии:

  • клюквенный сок или таблетки
  • пить много жидкости
  • ношение хлопкового нижнего белья и свободная одежда
  • отказ от еды и напитков, которые, по вашему мнению, ухудшают ваши симптомы

Альтернативные методы лечения

Там же другие нехирургические процедуры при цистите.Иногда растяжение мочевого пузыря водой или газом может временно улучшить симптомы.

Стимуляция нервов может снизить частоту посещения туалета и уменьшить боль в области таза. А при цистите, вызванном лучевой или химиотерапией, лекарства могут помочь промыть мочевой пузырь.

Перспектива цистита зависит от причины симптомов. В целом прогноз при цистите хороший. Однако важно как можно скорее вылечить основное заболевание. Если вы испытываете симптомы цистита, лучше всего обратиться к врачу.

Во время выздоровления от цистита вам следует:

  • пить много жидкости
  • избегать напитков с кофеином, так как они могут раздражать ваш мочевой пузырь
  • частое мочеиспускание, а не «сдерживание»
  • носить хлопковое белье и свободную одежду

Женщинам следует протирать кожу спереди назад после дефекации, чтобы предотвратить распространение бактерий из фекалий. Кроме того, также может помочь принятие душа вместо ванны. Обязательно аккуратно промойте кожу в области гениталий.

Женщинам следует опорожнить мочевой пузырь после полового акта и пить воду. Наконец, избегайте любых продуктов, которые раздражают эту область.

Дисбактериоз: симптомы, лечение и средства правовой защиты

Домашний блог

Реклама

Ваше тело содержит разнообразные колонии различных микроорганизмов, обитающих в слизистых оболочках пищеварительной системы.В среднем в кишечнике взрослого человека обитает от 300 до 500 различных типов бактерий. Некоторые бактерии полезны для вашего организма, а другие могут быть вредными (если они разрастаются). В здоровом организме полезных бактерий будет больше, чем плохих. К сожалению, определенные факторы могут вызвать нарушение баланса между вредными и защитными кишечными бактериями. Дисбактериоз, также известный как дисбактериоз, можно описать как состояние, которое возникает при дисбалансе хороших и вредных бактерий в вашем организме.

Причины дисбактериоза

Существует несколько различных факторов, которые могут вызвать чрезмерный рост вредных или вредных бактерий в вашей системе. Существует ряд заболеваний, которые тесно связаны с дисбактериозом, например —

  • Хронические заболевания желудочно-кишечного тракта
  • Аутоиммунные болезни
  • Воспалительные болезни

Ниже приведены некоторые из наиболее частых причин дисбактериоза —

  • Нарушение желудочной секреции
  • Запор или диарея
  • Рак
  • Снижение иммунного статуса
  • Неподходящее или повторяющееся использование антибиотиков или стероидов
  • Радиация
  • Спастический колит
  • Использование оральных контрацептивов (таблетки)

Вы также можете увеличить риск дисбактериоза, если будете соблюдать диету, содержащую —

  • Сера
  • Избыточное количество белков, углеводов и жиров
  • Низкое количество клетчатки

Микроорганизмы, живущие в вашем теле, обладают пониженной способностью контролировать рост друг друга.Это приводит к чрезмерному росту некоторых колоний, которые наносят ущерб более мелким и более полезным.

Симптомы дисбактериоза

Есть несколько признаков и симптомов, которые могут предупредить вас о наличии микробного дисбаланса в вашем теле. Ниже приведены некоторые симптомы дисбактериоза —

.

  • Вздутие живота
  • Нарушение реакции кишечника, например, запор или диарея
  • Избыточное метеоризм
  • Усталость и слабость
  • Галитоз или неприятный запах изо рта
  • Тошнота, иногда рвота

Обратитесь к врачу, если вы заметили какой-либо из упомянутых выше симптомов.Ваш врач может посоветовать вам пройти тест, известный как «Тест на мочеиспускание» или «Тест Обермайера». Для этого теста образец мочи будет смешан с 2 реагентами, и цвет будет оценен в соответствии с таблицей. Вся процедура займет около 10 минут. Поговорите со своим врачом о продуктах, которые вам нужно есть и которых следует избегать, не позднее чем за день до теста.

Лечение дисбактериоза

Лечение дисбактериоза направлено на замену защитных бактерий в организме.Однако это намного сложнее, чем думает большинство людей, потому что многие полезные бактерии, принимаемые перорально, убиваются желудочными кислотами, прежде чем они достигнут вашего кишечника.

Самый эффективный способ увеличить количество полезных бактерий в вашем организме — это внести несколько долгосрочных изменений в рацион. Ниже приведены продукты, которые следует включать в диету при дисбактериозе —

  • Миндаль и миндальное масло
  • Яблоки
  • Ягоды
  • Каштаны
  • Творог
  • Фундук
  • Домашний йогурт (простой и несладкий)
  • Листовые зеленые овощи
  • Лаймы и лимоны
  • Дыни
  • Персики
  • Кедровые орехи
  • Овощи сырые
  • Сыр рикотта
  • Цельнозерновые и мультизерновые продукты

Есть несколько продуктов, которых следует избегать, так как они увеличивают рост вредных бактерий.Ниже приведены продукты, которые следует исключить из диеты при дисбактериозе —

  • Сладости, искусственные подсластители и сладкие продукты, включая мед, свеклу, тростниковый сахар, кленовый сироп, кукурузный сироп и патоку
  • Тропические фрукты, финики, сливы, инжир, айва и мускадин, а также фруктовые соки
  • Овощи с высоким содержанием сахара, такие как картофель, ямс и опунция
  • Белые зерна, белый рис и ржаная мука
  • Уксус и гидрогенизированное масло
  • Напитки алкогольные, особенно пиво и вино
  • Соленья и приправы
  • Продукты животного происхождения, такие как мясо и плавленый сыр

Однако важно проконсультироваться с врачом, прежде чем вносить какие-либо серьезные изменения в свой рацион.Не ешьте продукты, упомянутые выше, если вы страдаете аллергией или непереносимостью по отношению к ним. Более того, никогда не вносите никаких изменений в прием лекарств без предварительного разрешения врача.

Дисбактериоз кишечника. Симптомы и лечение

А Качественное и количественное изменение правого видового состава микрофлоры кишечника или кожи называется дисбактериозом.То есть это микробное состояние, которое характеризуется дисбалансом микрофлоры внутри организма или на его поверхности. Наиболее заметные признаки дисбактериоза кишечника проявляются в желудочно-кишечном тракте, но они также могут возникать на коже, любой открытой поверхности или слизистой оболочке тела. Это касается влагалища, легких, ротовой полости, носовой полости и придаточных пазух носа, ушей, ногтей или глаз. Причины дисбактериоза связаны с различными заболеваниями, такими как воспалительные заболевания кишечника и синдром хронической усталости.

В небольших количествах в большинстве случаев полезны микробные колонии. Они выполняют несколько важных функций и защищают организм от проникновения болезнетворных микробов. Эти полезные колонии микробных организмов конкурируют друг с другом, чтобы поддерживать баланс между ними и избегать доминирования определенных микроорганизмов. Когда этот баланс нарушается различными антибиотиками, их неправильным употреблением или злоупотреблением алкоголем, микробные колонии обнаруживают снижение способности контролировать рост друг друга.Это может привести к чрезмерно быстрому росту одной или нескольких колоний, которые затем повредят некоторые другие полезные бактерии, что приведет к дисбактериозу кишечника. Симптомы зависят от тяжести заболевания.

Рекомендуется

Что делать, если у вас потрескалась кожа на руках?

Каждый из нас хоть раз в жизни сталкивается с небольшой, но очень, при этом, потрескавшейся кожей на руках. В это время появляются ранки разного размера, которые болят и доставляют неудобства, особенно при контакте с водой или моющими средствами….

Дисбактериоз Обычно сопровождается сильной слабостью, недомоганием, снижением работоспособности и головной болью. Если у вас бледное лицо и общая изможденная внешность, живот мужчины вздут. Младенцы плачут из-за того, что у них возникают боли внизу живота, которые у новорожденных обычно сопровождаются дисбактериозом кишечника. Симптомы: вздутие живота, урчание и диарея (диарея). Стул зеленоватый, кашицеобразной консистенции, имеет зловонный запах, при частом водянистый. Пациент потерял аппетит.

Существует четыре стадии этого заболевания, которые, напомним, не входят в Международную классификацию болезней.Зарубежные специалисты часто используют такой термин, как SYBR, называемый синдромом избыточного бактериального роста. СИБР диагностируется, если в 1 дм3 аспирата тонкой кишки обнаружено более 105 микроорганизмов и флора тонкой кишки приближается к состоянию, характерному для толстой кишки. В нашей стране лишь некоторым врачам поставлен диагноз «дисбактериоз кишечника», симптомы которого зависят от конкретной стадии.

На первом этапе значительно сдерживается развитие патогенной микрофлоры, но признаки кишечной дисфункции отсутствуют.На втором этапе происходит критическое уменьшение количества лактобацилл и бифидобактерий кишечника, то есть облигатно изменяется флора и быстро развиваются колонии патогенных бактерий, в результате начинают проявляться признаки дисфункции кишечника (метеоризм, боли в животе и жидкий стул зеленоватого цвета). Для третьей стадии характерно воспаление стенок кишечника из-за развития патогенной микрофлоры. Вот уже хронический дисбактериоз кишечника.Симптомы характеризуются появлением в стуле непереваренных частиц пищи, а для детей существует риск недоразвития. Четвертой стадии предшествует острая кишечная инфекция из-за фактического отсутствия облигатной флоры. Различают условно-патогенные и патогенные бактерии и грибки. Результат — недостаточность, анемия и кахексия.

Если врач поставил диагноз «дисбактериоз кишечника», лечение и симптомы должны быть связаны с первопричинами (например, из-за чрезмерного употребления антибиотиков или в результате инфекционных заболеваний).Только после этого появляются необходимые препараты, содержащие дефицитные для организма бактерии, образующие облигатную флору и способные восстановить баланс между конкретными микробными колониями. Больному назначаются препараты, подавляющие патогенную микрофлору, а также препараты, содержащие ферменты (необходимые для обеспечения химических реакций пищеварения), которые у здорового человека продуцируют полезную микрофлору.

Границы | Микробиомы человека и их роль в дисбактериозе, распространенных заболеваниях и новые терапевтические подходы

Введение

Эволюция Homo sapiens связана с мутуалистическим партнерством с микробиотой кишечника человека.Геном человека является частью коллективного генома сложного комменсального, симбиотического и патогенного микробного сообщества, которое колонизирует человеческое тело. Наш микробиом включает не только бактерии, но также вирусы, простейшие и грибы (Backhed et al., 2012). Бактерии — это обширная группа живых организмов, которые сами по себе считаются сферой жизни (Woese et al., 1990). Они классифицируются с помощью тестов на основе ДНК, морфологически и биохимически на основе типа клеточной стенки, формы клетки, потребности в кислороде, продукции эндоспор, подвижности и потребности в энергии.Ганс Христиан Грам (1850–1938), датский ученый, обнаружил, что присутствие высоких уровней пептидогликана (50–90%) дает темно-фиолетовый цвет, в то время как низкие уровни (<10%) приводят к красноватым / розоватым цветам, которые представляют собой соответствующее окрашивание грамположительных и грамотрицательных бактерий. Стенка грамотрицательных клеток также характеризуется наличием липополисахаридов (ЛПС). В зависимости от их способности производить энергию в присутствии или в отсутствие кислорода бактерии также можно классифицировать как аэробные, анаэробные или факультативно анаэробные.В дополнение к выработке АТФ посредством аэробного или анаэробного дыхания бактерии также могут производить энергию посредством ферментации. Факультативные анаэробные бактерии способны генерировать АТФ с кислородом или без него, в то время как обязательные анаэробные бактерии не переносят его и выживают только при анаэробиозе. Lactobacillus, Staphylococcus и Escherichia coli являются примерами факультативных анаэробных бактерий. С другой стороны, Bacteroides являются обязательными анаэробными видами.В воспаленных тканях энтероциты производят активные формы кислорода (АФК) и убивают анаэробные бактерии, увеличивая количество аэробных и факультативных видов.

Бактерии классифицируются филогенетически на основе анализа нуклеотидных последовательностей малых субъединичных оперонов рибосомной РНК, в основном вариабельных областей бактериальной специфической рибосомной РНК, 16S рРНК (Woese, 1987; Woese et al., 1990; Marchesi et al., 1998) . В настоящее время домен Bacteria разделен на множество типов; однако большинство микробов, образующих микробиоту человека, можно отнести к четырем основным типам: Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria (Zoetendal et al., 2008; Arumugam et al., 2011; Segata et al., 2012). Firmicutes и Bacteroidetes составляют более 90% относительной численности микробиома кишечника (Arumugam et al., 2011; Segata et al., 2012). Фирмикуты — это разнообразный тип, состоящий в основном из классов Bacilli и Clostridia. Это грамположительные, анаэробные (Clostridia) и облигатные или факультативные аэробы (Bacilli), характеризующиеся низким содержанием GC. Бактерии видов Clostridium продуцируют эндоспоры, чтобы выжить в неблагоприятных (аэробных) условиях (Paredes-Sabja et al., 2014). Тип Bacteroidetes состоит из грамотрицательных, неспорообразующих анаэробных бактерий, которые переносят присутствие кислорода, но не могут использовать его для роста. Актинобактерии (например, Bifidobacterium) — это грамположительные бактерии с множественными ветвями, неподвижные, не образующие спор и анаэробные бактерии. Протеобактерии (например, Escherichia , Klebsiella, Enterobacter ) представляют собой аэробные или факультативно анаэробные грамотрицательные неспорообразующие палочкообразные бактерии, которые обитают в кишечном тракте всех позвоночных.

Недавние обзорные исследования вариабельности микробиомов человека пришли к выводу, что европейские люди могут быть классифицированы до трех энтеротипов на основе данных гена 16S рРНК и данных функционального метагенома (полногеномного дробовика) (Arumugam et al., 2011; Koren et al., 2013). Энтеротип относится к относительному количеству конкретных бактериальных таксонов в микробиомах кишечника человека. Функциональный метагеном каждого энтеротипа выявил различия в пропорциях генов, участвующих в углеводном и белковом обмене, что согласуется с диетами разных популяций (Arumugam et al., 2011; Корен и др., 2013). Люди различаются по видовому составу, распространению, разнообразию и количеству бактерий (Яцуненко и др., 2012). Пищевые привычки являются решающим фактором. Разнообразие (вариативность и сложность микробиома) увеличивается с рождения и достигает своего пика в раннем взрослом возрасте, а затем уменьшается с возрастом. Однако необходимо провести более масштабные лонгитюдные исследования, охватывающие большее количество популяций, таких как южноамериканцы, индийцы и африканцы, чтобы определить фактическую структуру и биологическое воздействие отдельных микробиомов человека.Эти исследования могут также выявить, как эволюция образа жизни влияла на микробиомы предков и современных людей. Здесь мы представим и обсудим последние достижения в исследованиях микробиома и стратегии разработки инновационных фармацевтических препаратов на основе геномной информации о новых популяциях и индивидуальной микробиоте.

Метагеномика

Недавняя разработка технологий секвенирования следующего поколения (NGS), таких как секвенаторы 454, Solexa / Illumina, Ion Torrent и Ion Proton, а также параллельное расширение мощных программ биоинформатики сделали возможным геномный анализ более 1000 прокариотических и 100 эукариотических организмов, включая более 1200 полных геномов человека (Flintoft, 2012; Belizario, 2013).Метагеномика — это биотехнологический подход к изучению геномных последовательностей некультивируемых микробов непосредственно из их естественных источников (Wooley et al., 2010). Это позволяет одновременно анализировать микробное разнообразие, связывая его с конкретными функциями в различных средах, таких как почва, морская среда и среда обитания человеческого тела (Ley et al., 2008; Robinson et al., 2010; Culligan et al., 2014) . Используя эти новые методы, ученые предоставили доказательства существования более тысячи видов микроорганизмов, обитающих в нашем организме (Arumugam et al., 2011; Segata et al., 2012) и оценка от 10 7 до 10 9 различных видов бактерий, живущих на Земле (Curtis et al., 2002). Что еще более важно, метагеномический подход может раскрыть совершенно новые гены, семейства генов и кодируемые ими белки, которые могут иметь биотехнологическое и фармацевтическое значение.

В настоящее время осуществляется несколько международных проектов, направленных на характеристику микробиоты человека. Проект микробиома человека (HMP) — это исследовательская инициатива Национального института здоровья (NIH) в США, цель которой — охарактеризовать микробные сообщества, обнаруженные в нескольких различных участках человеческого тела (Turnbaugh et al., 2007; Backhed et al., 2012; Проект микробиома человека, 2012a, b). MetaHIT (Метагеномика кишечника человека) — это проект, финансируемый Европейской Комиссией и находящийся под управлением консорциума из 13 европейских партнеров из академических кругов и промышленности. Международный консорциум микробиома человека (IHMC) состоит из научных учреждений Европы, Канады, Китая и США.

Простой молекулярный подход к исследованию микробного разнообразия основан на анализе вариабельных областей гена 16S рРНК с использованием «универсальных» праймеров, которые комплементарны высококонсервативным последовательностям среди гомологичных генов 16S рРНК (Marchesi et al., 1998; Каллиган и др., 2014). Эти гены содержат девять гипервариабельных регионов (V1 – V9), разнообразие последовательностей которых соответствует характеристикам составов бактериального сообщества в сложных образцах (Guo et al., 2013; Jiang et al., 2014; Montassier et al., 2014). Последовательности ДНК, полученные с помощью этого подхода, можно сопоставить с эталонным набором известных бактериальных геномов. Для этого доступны полезные инструменты и базы данных биоинформатики. Например, база данных SILVA представляет собой комплексный онлайн-ресурс для проверенных и выровненных данных последовательностей рибосомных РНК, который помогает определить оптимальное выравнивание для различных областей последовательностей (Pruesse et al., 2007). Проект Ribosomal Database Project (RDP), впервые выпущенный в 1995 году, представляет собой еще одну базу данных, которая обеспечивает высококачественное выравнивание последовательностей 16S рРНК архей и бактерий, а также последовательностей 28S рРНК грибов (Maidak et al., 1996). Профили микробов и филогенетическая кластеризация микробиомов населения Америки и Европы уже депонированы и доступны для ознакомления , . Проекты HMP и другие независимые проекты генерировали огромное количество метагеномных данных, и сборка микробиомных данных выполняется с помощью Genomes OnLine Database.Система управления данными для каталогизации и непрерывного мониторинга всемирных проектов секвенирования содержит данные из более чем 4000 проектов секвенирования метагеномов, в которых более 1500 нацелены на характеристику метагеномов, связанных с хозяином (Human Microbiome Jumpstart Reference Strains et al., 2010; Fodor et al. др., 2012; Редди и др., 2015).

Первый выпуск базы данных HMP включал данные микробиома носовых ходов, ротовой полости, кожи, желудочно-кишечного тракта и урогенитального тракта (Human Microbiome Project, 2012a, b).На рисунке 1 схематически представлены данные этих исследований. Результаты исследования более 690 микробиомов человека показали, что большинство бактерий микробиома кишечника принадлежит к четырем типам: Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria (Human Microbiome Project, 2012a, b). Лишь небольшая часть идентифицированных на данный момент микробов была успешно культивирована, а тысячи еще предстоит полностью секвенировать для более глубокого таксономического разрешения (штаммы и подвиды) и функционального анализа на геномном уровне (Qin et al., 2010; Робинсон и др., 2010; Abubucker et al., 2012; Флинтофт, 2012; Чжоу и др., 2013).

РИСУНОК 1. Таксономическое распределение, распространенность и численность таксонов микробов, которые населяют участки здорового человеческого тела, как это определено в проектах по микробиому человека (HMP). Цветные прямоугольники обозначают тип / класс и роды. Клинические исследования микробиома помогут выяснить связь между микробами и развитием большого количества заболеваний и патологических состояний, как показано на рисунке.Изображения были адаптированы из NIH HMP (http://www.hmpdacc.org/) и Национального исследовательского института генома человека (https://www.genome.gov/). TORCH, токсоплазмоз, другие инфекции (вирус Коксаки, ВИЧ, сифилис и др.), Краснуха, цитомегаловирус, простой герпес.

Метагеномные ассоциативные исследования, разрабатываемые во многих странах, являются многообещающими для прогнозирования новых диагностических и прогностических инструментов для многочисленных заболеваний человека. Результаты этих исследований значительно расширят наши знания о заболеваниях, связанных с микробным составом (Qin et al., 2010; Clemente et al., 2012; Флинтофт, 2012; Gevers et al., 2012). Чтобы лучше понять взаимодействия между хозяином, геном и микробами, а также роль непатогенных и патогенных штаммов в больших популяциях, нам необходимо сравнить профили микробиома на нескольких участках тела и наборах данных микробиома в нормальных и болезненных условиях, контролируемых окружающей средой. В следующих разделах мы представим синтез последних исследований микробиомов человека, выявленных в некоторых основных участках тела.

Микробиом кишечника

HMP показали, что в кишечнике человека есть одна из самых сложных и многочисленных экосистем, населенных более чем 100 триллионами микроорганизмов (Human Microbiome Project, 2012a, b). У взрослых большинство бактерий, обнаруживаемых в кишечнике, принадлежат к двум типам бактерий: грамотрицательным Bacteroidetes и грамположительным, Firmicutes; а другие, представленные на субдоминирующих уровнях, — это типы актинобактерий, фузобактерий и веррукомикробии, но это сильно варьируется у разных людей (Eckburg et al., 2005; Zoetendal et al., 2008; Arumugam et al., 2011; Backhed et al., 2012; Segata et al., 2012). Например, наиболее многочисленными родами из типа Bacteroidetes являются Bacteroides и Prevotella видов , которые составляют 80% всех Bacteroidetes в образцах фекалий. Тем не менее, многие таксоны, численно недостаточно представленные и менее распространенные виды бактерий, выполняют фундаментальные функции в определенном месте кишечника. Чтобы лучше определить эту различную микробную колонизацию и структуру микробиоты в разных когортах, возникла концепция «кластеров энтеротипов», которая позволяет классифицировать каждого человека на основе относительной численности конкретных бактериальных таксонов в образцах фекалий и их микробных метаболических и функциональных путей (Арумугам). и другие., 2011; Backhed et al., 2012; Корен и др., 2013). Результаты метагеномного секвенирования образцов фекалий европейских, американских и японских субъектов подтвердили наличие трех устойчивых кластеров с преобладанием Bacteroides (энтеротип 1), Prevotella (энтеротип 2) и Ruminococcus (энтеротип 3), каждый из которых характеризуется специфическим таксономическим составом и относительным обилием метаболических путей. Например, энтеротип 1 был обогащен биосинтезом биотина, пантотената и аскорбата рибофлавина; энтеротип 2 в биосинтезе тиамина и фолиевой кислоты.Энтеротип 3 показал большое количество генов, участвующих в пути биосинтеза гемма. Хотя в одном из этих исследований (Arumugam et al., 2011) было подтверждено, что набор из 12 генов коррелирует с возрастом, а набор из трех функциональных модулей — с индексом массы тела (ИМТ), потребуются дальнейшие исследования, чтобы определить, конкретный микробиом и / или энтеротип связан с полом, ИМТ, состоянием здоровья, диетой и возрастом людей (Arumugam et al., 2011; Backhed et al., 2012; Koren et al., 2013).

Несмотря на то, что микробиом кишечника стабилен в течение длительного периода времени, на его состав и функции может влиять ряд факторов, включая генетику, способ доставки, возраст, диету, географическое положение и лечение (Clemente et al., 2012; Brown et al., 2013). Кишечная микробиота приобретается в постнатальные периоды времени и состоит из широкого спектра бактерий, которые выполняют различные функции в организме человека-хозяина, включая всасывание питательных веществ, защиту от патогенов и модуляцию иммунной системы (Brown et al., 2013). . Кишечник — это анаэробная среда, в которой местные виды эволюционировали вместе с хозяином. Аэробные патогенные виды не могут вторгнуться и колонизировать его; однако анаэробные и факультативные патогенные виды могут вторгаться в него, вызывая заболевания.Высокое разнообразие определяет здоровый микробиом кишечника человека, тогда как сокращение разнообразия может быть связано с дисбактериозом (Manichanh et al., 2006; Backhed et al., 2012). Дисбиоз относится к дисбалансу в структуре микробиома, который является результатом ненормального соотношения комменсалов и патогенных видов бактерий. Многие исследования предполагают возможную прямую связь между дисбактериозом и воспалительными и метаболическими заболеваниями, такими как воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), включая колит и болезнь Крона (БК), ожирение и рак (Clemente et al., 2012; Сартор и Мазманян, 2012; Brown et al., 2013). Однако исследование такой сложной экосистемы затруднено, и все еще непросто определить, как изменения в микробном составе и численности членов могут приводить к заболеваниям. Индукция некоторых ВЗК была связана с уменьшением количества Firmicutes и Bacteroidetes и увеличением количества Proteobacteria. Например, Faecalibacterium prausnitzii , видный представитель Clostridium группы IV (Firmicutes), защитная и противовоспалительная комменсальная бактерия, часто снижается у пациентов с БК (Sokol et al., 2008; Сартор, Мазманян, 2012). Несмотря на эти достижения, следует отметить, что состав микробиоты варьируется в разных местах желудочно-кишечного тракта (Eckburg et al., 2005; Zoetendal et al., 2008; Arumugam et al., 2011; Cucchiara et al., 2012; Segata et al., др., 2012; Лепаж и др., 2013). Большинство исследований в литературе изучали только фекальную микробиоту. Образцы фекалий содержат от 1000 до 1150 видов бактерий, и до 55% не подлежат культивированию и, следовательно, не охарактеризованы (Zoetendal et al., 2008; Qin et al., 2010; Segata et al., 2012; Чжоу и др., 2014). Наши знания особенно ограничены, когда речь идет о других частях желудочно-кишечного тракта, потенциальном источнике не охарактеризованных видов микробов, что в значительной степени связано с ограничениями отбора проб.

Нарушение регуляции иммунной системы кишечника также может вызывать микробный дисбиоз (Clemente et al., 2012; Sartor and Mazmanian, 2012; Brown et al., 2013). Многие различные воспалительные заболевания характеризуются мутациями или утратой некоторых генов врожденного ответа в лимфоидных тканях, клетках Панета, меньших участках Пейера и мезентериальных лимфатических узлах (Clemente et al., 2012; Франц и др., 2012; Сартор, Мазманян, 2012). Рост сообществ микробиоты находится под контролем различных подсемейств генов-хозяев, кодирующих антимикробные пептиды (AMP). АМП являются наиболее древним компонентом врожденного ответа хозяина на бактериальные инфекции (Guani-Guerra et al., 2010; Ostaff et al., 2013). Когда бактерии колонизируют определенную среду обитания человека, экспрессия AMP, включая α- и β-дефенсины и кателицидины, активируется, чтобы ограничить распространение бактерий.Равновесие между иммунной системой и иммунорегуляторными функциями бактерий представляется тонким балансом, при котором потеря определенного вида может привести к чрезмерной реакции или подавлению врожденной иммунной системы (Round and Mazmanian, 2009; Clemente et al., 2012 ; Sartor, Mazmanian, 2012; Brown et al., 2013). Эпителиальные клетки кишечника (IEC) образуют физический и иммунологический барьер, который отделяет бактерии просвета от иммунных клеток слизистой оболочки кишечника. IEC и гематопоэтические клетки экспрессируют множество рецепторов, называемых рецепторами распознавания образов (PRR), которые опосредуют взаимодействия между иммунной системой и комменсальной микробиотой (Frantz et al., 2012). Толл-подобные рецепторы (TLR) и рецепторы, подобные домену ядерной олигомеризации (NLR), являются примерами PRR, которые распознают уникальные микробные молекулы, называемые микробно-ассоциированными молекулярными структурами (MAMP), включая липополисахариды (LPS), липид A, пептидогликаны, жгутики и микробные микроорганизмы. РНК / ДНК. Эти рецепторы активируют инфламмасомы и, тем самым, продукцию цитокинов TNF-α и IL-1β (Brown et al., 2013; Sangiuliano et al., 2014). Фактор миелоидной дифференцировки MyD88 — это адаптерный белок, который необходим для передачи сигналов TLR, взаимодействия хозяина и микробов и тканевого гомеостаза (Sangiuliano et al., 2014). У мышей, лишенных MyD88 в IECS (мыши IEC-Myd88 — / -), наблюдается нарушение кишечного барьера, дефицит продукции провоспалительных цитокинов и AMP и чрезмерный рост нескольких кишечных бактериальных патогенов (Frantz et al., 2012). Будет важно понять, когда и как дисбактериоз и генетические дефекты слизистых оболочек и врожденных регуляторных механизмов могут привести к развитию инфекционных или воспалительных заболеваний.

Микроорганизмы синтезируют широкий спектр низкомолекулярных сигнальных молекул (метаболитов), многие из которых похожи на метаболиты, продуцируемые клетками человека (Wikoff et al., 2009). Поддержание стабильной ферментативной микробиоты кишечника требует диеты, богатой цельными растительными продуктами, особенно с высоким содержанием пищевых волокон и полифенолов (Zoetendal et al., 2008). В анаэробных условиях виды, принадлежащие к роду Bacteroides , а также к семействам Clostridiaceae и Lactobacillaceae, продуцируют короткоцепочечные жирные кислоты (SCFA). Ацетат (с двумя атомами углерода), пропионат (с тремя атомами углерода) и бутират (с четырьмя атомами углерода) — это SCFA, используемые эпителиальными клетками толстой кишки (колоноциты), и играют важную роль в поддержании гомеостаза кишечника (Meijer et al., 2010). SCFAs индуцируют секрецию глюкагоноподобного пептида (GLP-1) и пептида YY (PYY), которые увеличивают всасывание питательных веществ из просвета кишечника. Это ключевой процесс в контроле разрастания слизистой оболочки, дифференциации и поддержания целостности слизистой оболочки (Round and Mazmanian, 2009). Лица, колонизированные бактериями родов Faecalibacterium, Bifidobacterium, Lactobacillus, Coprococcus и Methanobrevibacter , имеют значительно меньшую тенденцию к развитию заболеваний, связанных с ожирением, таких как диабет 2 типа и ишемические сердечно-сосудистые расстройства (Ley et al., 2006; Ле Шателье и др., 2013). Эти виды характеризуются высокой продукцией лактата, пропионата и бутирата, а также более высокой производительностью водорода, которая, как известно, ингибирует образование биопленок и активность патогенов, включая Staphylococcus aureus , в кишечнике (Le Chatelier et al., 2013 ). Генетические и индуцированные диетой мышиные модели ожирения показали, что соотношение Bacteroidetes / Firmicutes снижено у тучных животных по сравнению с животными без ожирения, что согласуется с тем, что наблюдалось у людей с ожирением (Ley et al., 2005, 2006; Ле Шателье и др., 2013; Вердам и др., 2013). Однако существуют разногласия относительно данных о составе кишечной микробиоты человека в связи с ожирением (Turnbaugh et al., 2009; De Filippo et al., 2010; Verdam et al., 2013). Изменения кишечной микробиоты у мышей с ожирением могут увеличивать проницаемость кишечника и воспаление локально и в жировых тканях (Cani and Delzenne, 2011; Kootte et al., 2012). Как обсуждалось в недавних исследованиях, LPS микробного происхождения, выделяемый в кровоток, может способствовать воспалительному процессу низкой степени и метаболическим нарушениям, связанным с ожирением, таким как инсулинорезистентность и диабет 2 типа (Cani and Delzenne, 2011; Kootte et al., 2012). Несмотря на то, что в настоящее время мы не до конца понимаем механизмы, были большие ожидания, что целевые изменения микробиоты путем рационального использования пребиотиков и пробиотиков могут устранить метаболические изменения, связанные с ожирением (Cani and Delzenne, 2011; Kootte et al., 2012).

Микробиом влагалища

Первое исследование, основанное на пиросеквенировании штрих-кодированных генов 16S рРНК вагинальной микробиоты, проведенное на образцах, взятых у североамериканских женщин, выявило внутренние различия внутри и между женщинами в разных этнических группах (Ravel et al., 2011). В недавних исследованиях микробный состав влагалища из трех участков влагалища (середина влагалища, шейка матки и интроитус) сравнивался со слизистой оболочкой щеки и перианальной областью (Fettweis et al., 2012; Romero et al., 2014; Vaginal Microbiome consortium ). Эти исследования показали, что влагалище обладает более чем 200 филотипами, и что большинство из них относятся к типам Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Fusobacteria (Ravel et al., 2011; Romero et al., 2014). Во влагалище низкий pH из-за секреции молочной кислоты и перекиси водорода Lactobacillus sp.Если Lactobacillus уменьшается под действием антибиотиков, то Gardnerella vaginalis и Peptostreptococcus anaerobius , Prevotella sp., Mobiluncus sp. Sneathia , Atopobium vaginae , Ureaplasma , Mycoplasma и многочисленные привередливые или некультивируемые анаэробы могут вызывать бактериальный вагиноз (БВ). БВ — это экологическое нарушение микробиоты влагалища, которое поражает миллионы женщин ежегодно и связано с многочисленными неблагоприятными последствиями для здоровья, включая преждевременные роды и заражение инфекциями, передаваемыми половым путем, например.g., HIV, Neisseria gonorrhoeae , Chlamydia trachomatis и HSV-2 (Kenyon et al., 2013). Lactobacillus морфотипы преобладают в нормальной степени 1. BV степени 3 и выше характеризуются уменьшенным количеством лактобацилл и повышенным разнообразием, особенно высокой концентрацией грамотрицательных бактерий и коккобацилл (например, G. vaginali s и G. mobiluncus) и Peptostreptococcus (Delaney and Onderdonk, 2001). Результаты исследований микробиома влагалища показывают различные закономерности и дисбаланс в бактериальных сообществах, связанных с БВ, а также те, которые связаны с неинфекционными патологическими состояниями, которые предсказывают повышенный риск бесплодия, самопроизвольного аборта и преждевременных родов.

Микробиом полости рта

Достижения в методах микробиологической диагностики показали сложное взаимодействие между микробиотой полости рта и хозяином (Segata et al., 2012; Jiang et al., 2014; Perez-Chaparro et al., 2014). Бактерии, грибы, археи, вирусы и простейшие являются частью микробиома полости рта. HMP исследовал бактериальные сообщества в девяти участках полости рта: слизистая оболочка щеки, твердое небо, ороговевшая десна, небные миндалины, слюна, суб- и наддесневой налет, горло и тыльная сторона языка (Human Microbiome Project, 2012a, b).Выявлено более 300 родов, относящихся к более чем 20 типам бактерий (Zhou et al., 2013; Jiang et al., 2014). Однако лишь ограниченное число видов находят подходящие условия для колонизации системы корневых каналов (Zhou et al., 2013; Perez-Chaparro et al., 2014). Микробиота пародонтита или кариеса обычно представляет собой сложный комплекс, состоящий из грамотрицательных анаэробных бактерий, таких как Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Prevotella intermedia, Tannerella forsythia и Agregatibacter actinomycetemcomitans (Mason et al., 2013; Jiang et al., 2014). Самые ранние данные об эндодонтической микробиоте были получены методом культивирования, и вполне вероятно, что еще не культивируемые и неизвестные виды бактерий играют роль в сдвиге микробов полости рта в сторону заболевания (Mason et al., 2013; Zaura et al. ., 2014). Как и ожидалось, данные глубокого секвенирования ДНК выявили большее количество таксонов, вовлеченных в эндодонтические инфекции. Чаще встречались виды типов Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria, Spirochaetes, Synergistetes и Candidatus Saccharibacteria .Все эти исследования бактериального разнообразия при эндодонтических инфекциях выявили высокую межпредметную вариабельность, что указывает на необходимость дальнейших исследований с использованием критериев однородности диагностики у значительного числа здоровых субъектов (Mason et al., 2013; Jiang et al., 2014; Perez- Chaparro et al., 2014).

Микробиом кожи

Кожа — самый большой орган человеческого тела, населенный более чем 100 микробными филотипами, большинство из которых безвредны или даже полезны для своего хозяина (Rosenthal et al., 2011; Ladizinski et al., 2014; Чжоу и др., 2014). Филотипы, численность и разнообразие микробов различаются в зависимости от цвета кожи, расы и географического положения (Grice et al., 2009; Rosenthal et al., 2011). Колонизация зависит от экологии и слоев эпидермиса поверхности кожи. Следовательно, он сильно варьируется в зависимости от топографического местоположения, эндогенных факторов хозяина и экзогенных факторов окружающей среды. Тип Actinobacteria наиболее распространен на коже. Грамположительные Staphylococcus epidermidis и Propionibacterium acnes преобладают на эпителии человека и в сальных фолликулах соответственно. Propionibacterium acnes колонизирует здоровые поры и отвечает за производство SCFA и тиопептидов, которые подавляют рост Staphylococcus aureus и Streptococcus pyogenes . Однако, в зависимости от иммунной системы хозяина, чрезмерный рост и закупорка пор делают возможной последующую колонизацию S. epidermidis и Staphylococcus aureus. Атопический дерматит — одно из хронических воспалительных состояний кожи, которое встречается у многих детей и взрослых (Grice et al., 2009). Staphylococcus sp. Коринебактерии sp. и грибы Candida sp и Malassezia sp. также часто связаны с рядом кожных заболеваний, включая атопический дерматит, аномальное шелушение и зуд кожи головы (Grice et al., 2009).

Микробиота кожи находится под автономным контролем местной кожной иммунной системы, поэтому она не зависит от системного иммунного ответа, который модулируется микробиотой кишечника (Naik et al., 2012). Основной врожденный механизм противомикробной защиты кожи состоит из АМП, например, дефензинов, кателицидина LL-37 и дермцидина (Guani-Guerra et al., 2010). Эти пептиды становятся важными инструментами в борьбе с кожными патогенными бактериями, а также с бактериями, вызывающими заболевания легких и желудочно-кишечного тракта. Многие AMP связываются с поверхностями фосфолипидных мембран, образуя ионные каналы и поры, вызывая утечку и гибель клеток (Guani-Guerra et al., 2010; Ostaff et al., 2013). Однако их специфическая иммуномодулирующая роль в врожденной иммунной защите против бактериальных и вирусных инфекций остается плохо изученной (Ostaff et al., 2013; Wang, 2014). Более глубокое понимание микробиома кожи необходимо для понимания AMP и врожденного ответа при кожных заболеваниях человека. Кожные воспалительные заболевания, такие как атопический дерматит, псориаз, экзема и синдромы первичного иммунодефицита, связаны с дисбиозом микробиоты кожи. Комменсалы кожи способствуют ответу эффекторных Т-клеток благодаря своей способности контролировать передачу сигналов NF-κB и продукцию цитокинов TNF-α и IL-1β (Hooper et al., 2012). Связывание компонентов микробиоты кожи с TLR или NLR обеспечивает устойчивый гомеостаз в отношении врожденного и адаптивного иммунитета в рамках сложного эпителиального барьера на различных топографических участках кожи.

Микробиом плаценты

Исторически плод и внутриутробная среда считались стерильными. Однако первый профиль микробов при здоровых доношенных беременностях выявил уникальную нишу микробиома в нормальной плаценте, состоящую из непатогенной комменсальной микробиоты из типов Firmicutes, Tenericutes, Proteobacteria, Bacteroidetes и Fusobacteria (Aagaard et al., 2014). В этом исследовании описаны микробные сообщества 320 образцов плаценты, и, несмотря на ожидаемые различия между людьми, таксономическая классификация микробиома плаценты имеет наибольшее сходство с микробиомом полости рта небеременных, в частности, с микробиомом языка, миндалин и десневых бляшек . Одним из преобладающих видов был Fusobacterium nucleatum , грамотрицательный оральный анаэроб. E. coli также была обнаружена в плаценте; однако он не присутствует в микробиоме полости рта (Aagaard et al., 2014). Авторы предположили возможное гематологическое распространение микробиома полости рта во время ранней васкуляризации и плацентации. Пути, связанные с метаболизмом кофакторов и витаминов, были наиболее распространенными среди профилей функциональных генов плаценты, что отличается от метаболических путей, обнаруженных в других участках тела (Aagaard et al., 2014).

Баланс различных видов микробов в организме человека и на нем изменяется на протяжении всей жизни, особенно на разных стадиях беременности (Qin et al., 2010; Проект микробиома человека, 2012a, b). Хорошо известно, что преждевременные роды (<37 недель) вызывают значительную неонатальную смертность и заболеваемость (DiGiulio et al., 2008). Плаценты от нормальных и преждевременных родов содержали разные популяции микробных видов (Groer et al., 2014). Грам-отрицательная палочка Durkholderia была связана с преждевременными родами, а грамположительные палочковидные факультативные анаэробные бактерии Paenibacillus — с срочной доставкой (Aagaard et al., 2014). В соответствии с другими исследованиями, обогащение Streptococci, Acinetobacter и Klebsiella также было продемонстрировано у женщин с анамнезом антенатальной инфекции (Aagaard et al., 2014).

Присутствие различных микробов в околоплодных водах, пуповинной крови, мекония (первый стул), плацентарных и плодных оболочках предполагает существование различных путей и механизмов, с помощью которых бактерии из разных микробиоты перемещаются в плаценту и младенцев (DiGiulio et al., 2008). Исследования на мышах продемонстрировали передачу через плаценту микробиотой ротовой полости матери (Fardini et al., 2010). Многие из этих организмов передаются младенцам во время кормления грудью. Младенцы, рожденные вагинально, имеют более разнообразные микробные сообщества кишечника, похожие на микробиоту влагалища их матери, в то время как микробиомы детей, рожденных с помощью кесарева сечения, аналогичны микробиоте кожи (Dominguez-Bello et al., 2010). Отсутствие контакта с материнским вагинальным микробиомом может объяснить, почему у детей после кесарева сечения повышен риск развития диабета 1 типа, целиакии, астмы и ожирения (DiGiulio et al., 2008; Домингес-Белло и др., 2010). Микробиом детей, находящихся на грудном вскармливании, обогащен видами Lactobacillus и Bifidobacterium , тогда как микробиом младенцев, которых кормили смесью / твердой пищей, обогащен энтерококками, энтеробактериями, Bacteroides, Clostridia и Streptococci (Guaraldi, 2012; Palvator al. 2012; Томпсон и др., 2015). Переход от грудного молока к твердой пище связан с приобретением микробиома, более похожего на взрослый; однако инфекционные заболевания, использование антибиотиков и особенности диеты могут влиять на состав микробиоты младенцев (Thompson et al., 2015). В совокупности эти результаты подчеркивают необходимость дальнейших исследований микробиома плаценты для выяснения большего количества механизмов, которые необходимо изучить для профилактики и лечения детей от преждевременных родов и других заболеваний.

Фармацевтические препараты на основе микробиоты

Метагеномика оказалась мощным инструментом в определении разнообразия и численности микробов в организме человека. Базы данных микробиома были изучены как источники интересных целей для разработки лекарств (Cani and Delzenne, 2011; Collison et al., 2012; Хайзер и Тернбо, 2012; Карр и др., 2013; Уоллес и Рединбо, 2013). Терапевтические вмешательства в микробиом могут быть направлены против молекулярных образований, таких как эссенциальные гены и гены устойчивости к антибиотикам, для компонентов систем контроля кворума, используемых для управления поведением микробных сетей, включая химическую коммуникацию и производство факторов вирулентности (Collison et al., 2012). В следующих разделах мы представим и обсудим стратегии по обнаружению новых противомикробных мишеней, а также диетические вмешательства и генетические инструменты модификации микробов для устранения патогенных микроорганизмов и контроля дисбактериоза.

Ориентация на основные гены

Поиск основных генов роста и жизнеспособности бактерий — это первый шаг к определению потенциальных мишеней для лекарств (Wallace and Redinbo, 2013). Вычислительный анализ может предоставить потенциальные мишени в микробном сообществе, имеющие фармакологическое значение для контроля видов бактерий, участвующих в хронических заболеваниях, метаболических и сердечно-сосудистых заболеваниях, а также в метаболизме лекарств (Collison et al., 2012). Метагеномные базы данных имеют решающее значение для построения генных и белковых сетей и исходной основы для скрининга мишеней лекарственных средств (Collison et al., 2012; Карр и др., 2013; Усадьба и Боренштейн, 2015). Несколько биоинформатических подходов были использованы для определения существенности микробных генов и предполагаемых новых классов и функций для уникальных микробных генов в метагеномных базах данных. HUMAnN — это программа для метагеномной функциональной реконструкции, чтобы напрямую связать функции сообщества с средой обитания и фенотипом хозяина. Эта программа использовалась для сравнения функционального разнообразия и экологии организма в микробиоме человека (Abubucker et al., 2012). Около 20% всех генов в штамме являются важными, и это вызвало интерес в исследованиях по открытию новых лекарств (Christen et al., 2011). In vitro Транспозиция и генетическая трансформация бактерий дикого типа с использованием библиотеки транспозонов — надежный экспериментальный подход к раскрытию важности генов (van Opijnen et al., 2009). ESSENTIALS — еще одно программное обеспечение для быстрого анализа данных высокопроизводительного секвенирования вставки транспозонов и обнаружения основных генов (Zomer et al., 2012).

Большинство уникальных мишеней, обнаруженных в геномах микробов, — это гены, ответственные за метаболизм углеводов, аминокислот, ксенобиотиков, метаногенез и биосинтез витаминов и изопреноидов. Эти гены либо негомологичны, либо ортологичны генам, содержащимся в геноме человека. Пути биосинтеза витаминов являются основным источником потенциальных мишеней для лекарств. Большинство бактерий синтезируют тиамин de novo , тогда как люди зависят от его потребления с пищей.Фолиевая кислота (витамин B9) — незаменимый кофактор, который играет ключевую роль в цикле метилирования и в биосинтезе ДНК. Ферменты пути биосинтеза фолиевой кислоты, например дигидрофолатредуктаза, были привлекательными фармацевтическими мишенями для ингибирования синтеза фолиевой кислоты. Сульфаниламид и триметоприм являются примерами эффективных противомикробных препаратов, используемых при широком спектре инфекционных заболеваний. Ниацин (витамин B3) участвует в биосинтезе никотинамидадениндинуклеотида (NAD + ), кофермента, необходимого в реакциях переноса электронов в процессах клеточного метаболизма.Бактериальные НАД + киназы были исследованы как мишени для подавления роста бактерий. Метионин de novo не синтезируется в организме человека и поступает с пищей. Напротив, большинству бактерий для выживания необходимо синтезировать метионин. S -аденозилметионинсинтетаза, ключевой фермент в биосинтезе метионина, является одной из мишеней лекарственного средства, большой потенциал которой был исследован против различных патогенов. Были успешно разработаны новые лекарственные препараты, например платенсимицин и платенцин, которые ингибируют путь микробного синтеза жирных кислот (FAS) путем воздействия на ключевые ферменты FAS (Parsons et al., 2014). Недавнее исследование выявило 127 ортологичных групп, сохраняющихся в комменсальной микрофлоре кишечника человека и человека, которые не являются подходящими мишенями для разработки лекарств. Однако среди них можно использовать 20 аминоацил-тРНК-синтетаз (aaRS), которые кодируют важные ферменты для синтеза белка, поскольку бактериальные и эукариотические AaRS имеют разную специфичность к тРНК (Ochsner et al., 2007; Mobegi et al., 2014) . Это лишь несколько примеров привлекательных мишеней для разработки лекарств; однако метагеномные данные откроют новые горизонты для открытия основных генов.

Нацеленность на гены устойчивости к антибиотикам

Структура микробного сообщества поддерживается специфической микробной коммуникацией, передачей клеточных сигналов через межклеточный контакт, метаболическими взаимодействиями и восприятием кворума (Wright, 2010). Виды в бактериальном сообществе либо восприимчивы, либо устойчивы к врожденным эпителиальным AMP и / или химическим антибиотикам (Seo et al., 2010; Wozniak and Waldor, 2010; Sommer and Dantas, 2011). Бактериальные геномы приобрели гены устойчивости и метаболизма из мобильных генетических элементов (MGE), включая конъюгативные транспозоны, также называемые интегративными конъюгативными элементами (ICE), которые горизонтально переносятся бактериофагами и плазмидами (Wozniak and Waldor, 2010).Гены устойчивости к антибиотикам, кодируемые в микробных геномах, включают переносчики потока множественных лекарственных средств, гены устойчивости к тетрациклину, гены устойчивости к ванкомицину и бета-лактамазы. Кроме того, ряд микробных генов и продуктов, включая бактериоцины, лизины, холины, эндонуклеазные системы рестрикции / модификации и другие факторы вирулентности, способствуют устойчивости к антибиотикам (Dawid et al., 2007; Seo et al., 2010; Wozniak and Waldor, 2010; Smillie et al., 2011). Целевые (на основе ПЦР) и функциональные метагеномные подходы использовались для отслеживания присутствия генов устойчивости или их семейств в различных экосистемах (Mullany, 2014).Был разработан метод специфического улавливания плазмид, содержащих гены устойчивости к антибиотикам, называемый захватом с помощью транспозонов (TRACA) (Jones and Marchesi, 2007; Mullany, 2014). В этом методе плазмиды помечаются транспозонами, которые содержат селектируемый маркер и точку начала репликации, которые облегчают получение плазмид из экстрактов метагеномной ДНК кишечника человека и последующее поддержание и селекцию в хозяине E. coli .

Большинство антибиотиков, используемых сегодня для борьбы с бактериальными инфекциями, получают из почвенных микробов.Пенициллин, первый настоящий антибиотик, был получен из почвенного гриба Penicillium (Kardos and Demain, 2011). Чтобы изучить роль почвенной микробиоты как резервуара генов, кодирующих устойчивость к антибиотикам, в наборе метагеномных данных, ORF, обнаруженные на контигах и на несобранных считываниях, сравнивали с 3000 известными генами устойчивости к антибиотикам (Forsberg et al., 2014). Был сделан вывод о том, что большинство идентифицированных генов устойчивости почвенных бактерий, как правило, не были близки к известным генам устойчивости человека к патогенным микроорганизмам, что позволяет предположить, что между видами почвенных и кишечных бактерий мало общего.Исследование микробиома индейцев, не контактировавших с нами, членов изолированной деревни яномами, проживающих в регионе Амазонки, показало самое высокое разнообразие бактерий и генетических функций в фекальном, оральном и кожном бактериальном микробиоме, о котором когда-либо сообщалось, по сравнению с группой США (Clemente et al ., 2015). Несмотря на их изолированность и отсутствие известного воздействия коммерческих антибиотиков, они несут функциональные гены устойчивости к антибиотикам с более чем 95% идентичностью аминокислот с генами, которые придают устойчивость к полусинтетическим и синтетическим антибиотикам монобактаму и цефтазидиму (Clemente et al., 2015). Это открытие дало важную информацию о том, как вестернизация влияет на наследуемость микробиома среди популяций (Яцуненко и др., 2012). Имеются данные, свидетельствующие о том, что воздействие микробов из микробиомов кишечника животных и внутри наших помещений (дома, офиса, школы, машины и т. Д.) Может стать новым источником антибиотиков и генов устойчивости к антибиотикам для популяций человека (Wright, 2010; Sommer and Dantas , 2011; Forslund et al., 2013). Эти открытия подчеркивают важность продолжения функциональных исследований резервуаров устойчивости к антибиотикам в метагеномных данных от изолированных предков и современных популяций с данным заболеванием.

Системы определения кворума нацеливания

Термин «Quorum Sensing» (QS) обозначает системы, используемые бактериями для связи друг с другом с целью синхронизации активности экспрессии генов и согласованного поведения группы (Miller and Bassler, 2001; Waters and Bassler, 2005; Hense and Шустер, 2015). Этот механизм контролирует синтез секретируемых продуктов, факторов вирулентности, вызывающих заболевания, и многих метаболитов, включая бактериальные антибиотики, нацеленные на конкурирующие бактерии, и вещества, подавляющие иммунную систему (Miller and Bassler, 2001; Waters and Bassler, 2005).Таким образом, альтернативой уничтожению или подавлению роста патогенных бактерий является нацеливание на эти ключевые регуляторные системы (Finch et al., 1998; Defoirdt et al., 2010). Метагеномные исследования выявили генетическое и фенотипическое разнообразие систем восприятия кворума, которые эволюционировали совместно с патогенными видами (Joelsson et al., 2006; Kimura, 2014). Система QS была впервые описана у морских бактерий Vibrio harveyi и V. fischeri , которые используют белки LuxI и LuxR для контроля экспрессии фермента люциферазы для излучения люминесценции при достижении критической массы или «кворума» (Nealson and Hastings, 1979).Эти бактерии выделяют во внеклеточную среду небольшую молекулу, ацилированный гомосеринлактон (AHL), называемый аутоиндуктором 1 (AI-1), для связи с представителями того же вида (внутривидовая коммуникация; Miller and Bassler, 2001; Waters and Bassler, 2005; Нг и Басслер, 2009). После открытия у морских бактерий системы QS были идентифицированы у более чем 70 различных видов бактерий, включая Streptococcus pneumoniae , Bacillus subtilis и Staphylococcus aureus (Miller and Bassler, 2001; Waters and Bassler, 2005; Ng. и Басслер, 2009).Системы QS контролируют не только биолюминесценцию, но и другие совместные процессы, такие как споруляция, конъюгация, получение питательных веществ, образование биопленки, биокоррозия, а также антибиотики и токсины (Waters and Bassler, 2005; Kimura, 2014; Hense and Schuster, 2015) . Примечательно, что бактерии не только могут общаться с представителями одного и того же вида, но они также способны ощущать присутствие разных видов в сообществе (межвидовая коммуникация). Эта межвидовая коммуникация осуществляется с помощью автоиндуктора второго типа (AI-2).Таким образом, в то время как каждый вид бактерий имеет свой собственный AI-1 для внутривидового взаимодействия, AI-2 является общим для всех грамотрицательных и грамположительных бактерий. На самом деле AI-2 не является отдельной молекулой, а скорее относится к группе молекул, принадлежащих к семейству взаимопревращающих фуранонов, производных 4,5-дигидрокси-2,3-пентандиона (DPD), биосинтез которых находится под контролем фермент LuxS (Xavier, Bassler, 2003). В последние годы ведется разработка новых соединений, способных нарушить механизмы QS.Например, ферменты, гасящие QS, такие как лактоназы и ацилазы, способны разрушать ацилированный гомосеринлактон (Dong and Zhang, 2005). Ряд соединений, называемых галогенированными фуранонами, продуцируемыми многими видами микробов, в основном принадлежащими к Proteobacteria, могут препятствовать путям AHL и AI-2 QS у грамотрицательных и грамположительных бактерий (Manefield et al., 2002; Rasko et al. ., 2008; Каюмов и др., 2014). Идентификация химических сигналов, рецепторов, генов-мишеней и механизмов передачи сигналов, участвующих в восприятии кворума, имеет важное значение для нашего понимания того, как связь бактериальная клетка-клетка может использоваться для предотвращения колонизации патогенными бактериями.Дополнительные данные метагеномных и метаболомических исследований помогут расшифровать бактериальные перекрестные помехи и взаимодействие микробиома и иммунной системы, и, в частности, отличительные механизмы регуляции.

Противодействие дисбактериозу

Трансплантация кала

Антибиотики использовались для лечения инфекционных заболеваний в течение последнего столетия. Однако ясно, что лечение антибиотиками может сделать людей более восприимчивыми к инфекциям (Dethlefsen et al., 2008; Forslund et al., 2013).Высокие дозы и частое использование антибиотиков могут нарушить и дестабилизировать нормальную микробиоту кишечника, предрасполагая пациентов к развитию инфекций, вызванных Clostridium difficile . До 35% этих пациентов заболевают хроническим рецидивом. Фекальная бактериотерапия — это трансплантация жидкой суспензии стула от донора (обычно члена семьи), который успешно использовался в тяжелых случаях рецидива C. difficile (Gough et al., 2011; Rupnik, 2015).Однако с этой терапией существует много проблем, поскольку она может увеличить риск передачи других патогенов (Brandt and Reddy, 2011).

Исследования трансплантации фекалий на мышах показали, что перенос микробиоты от тощих и толстых мышей к мышам, лишенным микробов, вызывает больший набор веса у тех, кто получает микробиоту от доноров жира (Ley et al., 2006). Открытие связи между микробиомом, ассоциированным с худой, открыло новую возможность использования трансплантированной микробиоты для лечения метаболических нарушений у людей.

Пробиотики и пребиотики

Пробиотики определяются как живые микроорганизмы, которые в конечном итоге улучшают баланс кишечной флоры, тем самым способствуя здоровым функциям кишечника за счет здорового кишечного микробиома (обзор в Gareau et al., 2010; Whelan and Quigley, 2013). Существует несколько анализов in vitro, для проверки фактической эффективности in vivo пробиотических микроорганизмов, которые включают конкретные биологические критерии, такие как устойчивость к низкому pH желудочного сока и способность достигать кишечника живым, чтобы оказывать благотворное влияние на организм человека ( Papadimitriou et al., 2015). Пробиотические микроорганизмы — это в основном бактерии, продуцирующие молочную кислоту, из родов Lactobacillus и Bifidobacterium . Также были исследованы другие микроорганизмы, такие как дрожжи Saccharomyces boulardii и бактерии E. coli Nissle 1917, Streptococcus thermophilus , F. parausnitzii и Bacillus polyfermenticus . Благоприятные терапевтические эффекты и механизмы действия лактобактерий и бифидобактерий у пациентов с желудочно-кишечными заболеваниями уже давно продемонстрированы (Ng et al., 2009). Эти пробиотики могут предотвратить или облегчить клинические симптомы синдрома раздраженного кишечника, воспалительного и некротического энтероколита и острой диареи (Ng et al., 2009; Gareau et al., 2010; Whelan and Quigley, 2013). Было обнаружено, что они могут регулировать баланс кишечной микробиоты, физически блокируя адгезию патогенных видов к эпителиальным клеткам. Это напрямую опосредовано увеличением продукции слизистого барьера бокаловидными эпителиальными клетками (Etzold et al., 2014). Кроме того, они могут регулировать проницаемость эпителия за счет усиления образования плотных контактов между клетками (Ng et al., 2009). Их иммуномодулирующие эффекты связаны со снижением продукции провоспалительных цитокинов, а также бактериоцинов микробных пептидов (Ng et al., 2009; Whelan and Quigley, 2013).

Использование пробиотиков не ограничивается желудочно-кишечными расстройствами. Исследования, оценивающие их применение в дерматологии, урологии и стоматологии, увеличиваются (Vuotto et al., 2014). Bifidobacterium bifidum используется для профилактики и лечения детской экземы. Было показано, что интравагинальное введение Lactobacillus rhamnosus GR-1 и L. fermentum RC-14 оказывает положительное влияние на профилактику рецидивов БВ и кандидоза (Anukam et al., 2006; Vuotto et al., 2014). Потребление пробиотиков может быть эффективным в профилактике кариеса зубов и заболеваний пародонта (Pandey et al., 2015). Непрерывное потребление Yakult’s л.casei штамм Shirota (LcS), один из самых популярных пробиотиков, в достаточных количествах может снизить риск рака за счет модуляции иммунной функции (Ishikawa et al., 2005). Наконец, было показано, что лечение мышей с ожирением с помощью Bifidobacterium infantis снижает продукцию провоспалительных цитокинов и вес белой жировой ткани (Cani et al., 2007). Влияние эндогенной микробиоты хозяина на ожирение и положительную роль пробиотиков, включая L. rhamnosus и gasseri и Bifidobacterium lactis , в лечении ожирения и ожирения, было рассмотрено в другом месте (Mekkes et al., 2014). Это новая область, в которой ведутся интенсивные исследования.

Пребиотики — это функциональные пищевые ингредиенты, которые могут изменять состав и / или активность кишечной флоры (Roberfroid, 2000; Roberfroid, 2007; Brownawell et al., 2012). Пищевая добавка с пребиотиками может способствовать росту полезных бактерий, таких как штаммы лактобактерий и бифидобактерий (Roberfroid, 2000, 2007). Плохо усваиваемые углеводы (волокна), такие как резистентный крахмал, некрахмальные полисахариды (например,g., целлюлозы, гемицеллюлозы, пектины и камеди), олигосахариды и полифенолы устойчивы к кислотности желудочного сока, всасываются в желудочно-кишечном тракте и не усваиваются при гидролизе ферментами млекопитающих. Бактерии толстой кишки посредством ферментов гидролиза углеводов и ферментации производят водород, метан, углекислый газ и SCFA, которые могут влиять на уровни энергии хозяина и регуляцию гормонов кишечника (Slavin, 2013). Наиболее часто используемые пребиотики — это фруктоолигосахариды (FOS) и трансгалактоолигосахариды (TOS), например, инулин (Roberfroid, 2000).Однако не все пищевые углеводы являются пребиотиками (Roberfroid, 2007). Смеси пробиотических и пребиотических ингредиентов использовались для выборочной стимуляции роста или активности полезных для здоровья бактерий. В заключение следует отметить, что терапевтическое использование про- и пребиотиков найдет больше применений в ближайшем будущем, когда крупномасштабные клинические испытания и метагеномные исследования определят, какие микробы активны, какие повреждены и какие могут реагировать на данный пребиотик. , пробиотик или синбиотик (синергическая ассоциация пробиотика и пребиотика) на геномном уровне (Nagata et al., 2011).

Фаговая терапия и CRISPR

Фаговая терапия заключается в использовании бактериофагов бактериальных вирусов (также известных как фаги) в качестве противомикробных агентов (Сулаквелидзе и др., 2001; Абедон, 2014). Бактериофаги прикрепляются к специфическим рецепторам, присутствующим в мембране хозяина, а затем вводят свой генетический материал в бактерию. Затем вирусные белки синтезируются с использованием трансляционного аппарата хозяина. Инфекция фагом может привести к лизису, лизогении или устойчивости. Литические бактериофаги вызывают гибель и разрушение клетки-хозяина для распространения инфекции, тогда как лизогенные (или умеренные) фаги вставляют свой геном в ДНК хозяина.Устойчивость может быть приобретена во время репликативных циклов путем транспозиции или рекомбинации генов.

Фаговая терапия потенциально может иметь положительное влияние на микробиомы человека и здоровье хозяина (Koskella and Meaden, 2013). Специфичность хозяина значительно ограничивает типы бактерий, которые будут вступать в контакт с конкретным фагом, что позволяет избежать уничтожения непатогенных видов (Koskella and Meaden, 2013). Однако для того, чтобы выбрать конкретный фаг для использования в качестве терапевтического агента, необходимо знать патоген, вызывающий данное заболевание.Когда это не так, использование коктейля из различных видов фагов расширит диапазон действия, но также может иметь возможное негативное влияние на микробные сообщества (Chan et al., 2013). Синергетическое использование фагов и низких доз антибиотиков, стратегия, названная синергизмом фага и антибиотика (PAS), может быть полезной в определенных клинических ситуациях (Comeau et al., 2007).

Бактерии выработали различные механизмы защиты от фаговых инфекций, которые действуют на разных уровнях.Фактически, они могут предотвратить прикрепление фага путем мутации / потери мембранных рецепторов или блокировать проникновение фаговой ДНК с помощью определенных мембранных белков. Кроме того, бактерии и археи разработали механизм внутреннего врожденного иммунитета, который позволяет им запоминать фаговую инфекцию, улавливая короткие последовательности ДНК из генетического материала фага. Эти вирусные последовательности интегрируются в виде спейсерных последовательностей в их собственные хромосомы, в частности, в массив повторяющихся последовательностей, называемых кластерными регулярными короткими палиндромными повторами или CRISPR, с помощью белков, кодируемых семейством генов Cas (связанных с CRISPR) (Гарно и al., 2010; van der Oost et al., 2014).

локусов CRISPR состоят из коротких (~ 24–48 нуклеотидов) повторов, разделенных уникальными спейсерами одинакового размера, обнаруженными в геномах архей (~ 90%) и бактерий (~ 40%) (Garneau et al., 2010; van der Oost и др., 2014). Гены Cas кодируют большое и гетерогенное семейство белков с функциональными доменами, типичными для нуклеаз, геликаз, полимераз и полинуклеотидсвязывающих белков. После инвазии организм-хозяин отбирает и интегрирует в свой геном короткие фрагменты чужеродной ДНК, называемые протоспейсерами, тем самым создавая иммунитет против этого конкретного инфекционного агента.Протоспейсер фланкирован повторяющимися областями и транскрибируется с ними в CRISPR-РНК (crRNA), которая направляет специфические нуклеазы к целевой ДНК, содержащей области, комплементарные протоспейсеру. Узнав, нуклеазы расщепляют инвазивную ДНК, предотвращая ее репликацию и блокируя инфекцию. Три различных типа и одиннадцать подтипов системы CRIPSR / Cas можно классифицировать на основе их репертуара белков Cas и механизмов действия (Plagens et al., 2015). Подробный список систем CRISPR-Cas типов I, II и III также доступен на веб-сайте CRISPRdb.Системы типа I характеризуются молекулярным механизмом, называемым каскадным комплексом (комплекс, связанный с CRISPR для противовирусной защиты), который проявляет активность никазы и экзонуклеазы. Системы типа III характеризуются наличием Cas10 (сигнатурный белок) и связанных белков. Системы делятся на подклассы типа III-A (CSM) и типа III-B (CMR), в зависимости от их специфичности для ДНК или РНК-мишеней. Кроме того, типы I и III имеют различное количество субъединиц загадочного белка, ассоциированного с повтором (RAMP) (Rouillon et al., 2013; Plagens et al., 2015).

Тип II представляет собой простейшую систему CRISPR-Cas, которая характеризуется наличием эндонуклеазы дцДНК Cas9 и трансактивирующей CRISPR-РНК (tracrRNA). TracrRNA отжигается с неизменными областями зрелой crRNA, создавая гетеродимеры РНК, которые, в свою очередь, образуют комплекс нуклеопротеидов с Cas9, направляя его к целевой ДНК. Cas9 распознает и связывается со специфическим мотивом 5′-NGG-3 ‘, который называется мотивом, примыкающим к протоспейсеру (PAM). Затем комплекс ищет последовательность, комплементарную спейсерной части crRNA.Cas9 содержит два нуклеазных домена, а именно RuvC и HNH, и вызывает двойной разрыв цепи в мишени. Впоследствии расщепленная ДНК становится субстратом механизмов репарации бактериальной ДНК, либо негомологичного соединения концов (NHEJ), либо гомологичной рекомбинации (HR). NHEJ — несовершенная система репарации и может вызывать вставку или делецию (инделки) пар оснований, а также однонуклеотидные полиморфизмы (SNP). Однако высокоточная репарация HR может произойти, если предоставлена ​​последовательность, комплементарная отщепленному фрагменту.Относительная простота механизма действия и особенности Cas9 делают систему CRISPR / Cas9 идеальным инструментом для широкого спектра процедур, особенно для редактирования генома (обзор у Ma et al., 2014; Selle and Barrangou, 2015; Xiao -Jie et al., 2015). Значительный объем работы в этой области уже был выполнен на различных организмах, особенно на эукариотах, с использованием модифицированных версий CRISPR / Cas9. С другой стороны, несмотря на его огромный потенциал, манипуляции с бактериальными геномами с помощью CRISPR / Cas9 до сих пор практически не выполнялись (Selle and Barrangou, 2015).CRISPR / Cas9 можно использовать для избирательного истощения данного бактериального сообщества определенного вредоносного штамма или вида (Vercoe et al., 2013; Gomaa et al., 2014; Yosef et al., 2015). Было показано, что существует обратная корреляция между присутствием локусов CRISPR и приобретенной устойчивостью к антибиотикам у Enterococcus fecalis (Palmer and Gilmore, 2010), что указывает на то, что использование антибиотиков может увеличить способность бактерий приобретать лекарственную устойчивость. кодирующие плазмиды. Система CRISPR / Cas9 может использоваться для введения специфических мутаций в основные гены, гены устойчивости к антибиотикам и вирулентности.Уже было показано, что путем предоставления в транс- ДНК (линейной или плазмидной), гомологичной целевой последовательности, можно ввести очень специфические мутации в желаемую мишень (Marraffini and Sontheimer, 2008; Jiang et al., 2013 ; Yosef et al., 2015). Также CRISPR / Cas9 может напрямую модулировать экспрессию определенных генов. Сконструированная версия Cas9, лишенная нуклеазной активности, но все еще сохраняющая свою связывающую способность (dCas9), уже была создана для репрессии бактериальной транскрипции путем связывания с промоторными областями или внутри ORF, таким образом блокируя инициацию и удлинение транскрипции, соответственно.dCas9 также может быть слит с регуляторными доменами для включения / выключения экспрессии специфических генов (Bikard et al., 2013; Qi et al., 2013). В ближайшем будущем создание комменсальных бактерий с улучшенными свойствами с использованием системы CRISPR / Cas может стать эффективным инструментом вакцинации в общественном здравоохранении для профилактики заболеваний. Однако, несмотря на большие успехи, еще предстоит проделать большую работу для улучшения целевой специфики и повышения эффективности.

Более полное представление о том, как фаготерапия и системы CRISPR / Cas9 могут быть использованы для борьбы с патогенными видами в нашем организме, особенно с устойчивыми к антибиотикам бактериальными патогенами, требует расширения in vitro , ex vivo и in silico подходы (Fritz et al., 2013). Уже разработано несколько общедоступных методов для специфического поиска протоспейсеров в эталонных микробиомах (Bi et al., 2012). Было предсказано более 123 003 протоспейсеров на основе 690 фаговых геномов (Zhang et al., 2013). Функциональное исследование патоген-специфичных бактериофагов и генная терапия зависит от разработки соответствующих моделей животных, включая трансгенных и свободных от бактерий животных (Fritz et al., 2013). Наконец, нам нужно будет подтвердить результаты проверки концепции в хорошо спланированных клинических испытаниях.На рисунке 2 мы графически суммируем некоторые фармакологические подходы, обсуждаемые в этой статье.

РИСУНОК 2. Возможные будущие терапевтические подходы к контролю дисбактериоза. Нарушения в экологическом сообществе комменсальных, симбиотических и патогенных микроорганизмов могут способствовать дисбактериозу. Это приводит к усилению бактериальной транслокации и / или высвобождения ассоциированных с микроорганизмами молекулярных паттернов (MAMP), которые активируют Toll-подобные рецепторы (TLR) в некоторых типах клеток.Активность местной и общей иммунной системы способствует воспалению, которое в конечном итоге приводит к хроническим заболеваниям. Новые терапевтические подходы, такие как фаговая терапия, нарушение функции Quorum Sensing и использование биотехнологического инструмента CRISPR / Cas9 для редактирования микробных геномов, могут нацеливаться на определенные бактериальные таксоны, помогая восстановить гомеостаз и баланс микробиома.

Экофармакология

Чтобы оценить взаимодействие человеческого организма с фармацевтическими препаратами, нам необходимо понять сложную взаимосвязь между экологией, физиологией и фармакологией (Rahman et al., 2007; Флинтофт, 2012; Хайзер и Тернбо, 2012). Из фармакогеномных исследований ясно, что вариации последовательности белков-мишеней лекарств, ферментов, метаболизирующих лекарственные средства, и переносчиков лекарств могут изменять эффективность лекарств, вызывать побочные эффекты, вызывая различные реакции на лекарства у отдельных пациентов (Wilson and Nicholson, 2009). Микроорганизмы участвуют в очень широком диапазоне биотрансформаций, включая гидролиз и переработку глутатионовых конъюгатов ксенобиотиков, выделяемых с желчью (Johnson et al., 2012). Следовательно, определение генетической изменчивости микробиомов человека может прогнозировать эффективность, биодоступность и вариабельность индивидуального ответа при лекарственной терапии.

Наконец, необходимы дальнейшие исследования, чтобы выяснить, оказывает ли огромное количество функциональных генных продуктов микробиоты неизвестные побочные эффекты и как они могут отрицательно или положительно влиять на реакцию на лекарства. Это основные исследовательские задачи для изучения потенциала метагеномики для лучшего понимания микробной экологии и перевода молекулярных и геномных данных в фармакомикробиомику (Saad et al., 2012). Согласно этой новой экологической парадигме, компетентность в знаниях, навыках и отношениях, а также комплексное экологическое сознание и социальная ответственность имеют важное значение для профессионалов, которые в будущем будут создавать и разрабатывать новое поколение экологически чистых и устойчивых фармацевтических продуктов, как показано на рисунке 3.

РИСУНОК 3. Действия и молекулярные подходы, направленные на защиту окружающей среды и микробных экосистем человека. Измерения экологических, филометагеномных и микробных метаболических вариаций в микробиомах требуют специального и сложного набора знаний.Сотрудничество между университетами, исследовательскими организациями, неправительственными организациями (НПО) и профессионалами фармацевтической промышленности имеет ключевое значение для оценки биологических и фармацевтических воздействий на экосистемы и выяснения механизма действия новых соединений в организме хозяина и его микробиомах. Полезность метагеномной функциональной реконструкции для прямой связи функций сообщества с средой обитания и фенотипом хозяина будет иметь решающее значение для надлежащего дизайна исследований и производства более экологичных фармацевтических продуктов для персонализированной медицины будущего.

Заключение и перспективы

Недавние успехи в проектах по секвенированию микробиома выявили высокую сложность микробных сообществ в различных участках человеческого тела. Они подтвердили важнейшую роль экосистемы человека и микробиоты в процессах, способствующих укреплению здоровья или вызывающих болезни. Эти исследования выявили неожиданные и широкомасштабные последствия устранения некоторых бактерий, живущих в нашем организме.

Хотя естественная изменчивость микробиоты человека еще не полностью определена, аннотации и анализ большого количества микробиомов человека показали, что присутствие или отсутствие конкретных видов микробов разделяет людей на категории на основе энтеротипов.Вполне вероятно, что культивируемые и некультивируемые микробы будут способствовать открытию новых фундаментальных биомаркеров конкретных заболеваний человека и могут стать лучшими дискриминационными инструментами, чем человеческие.

Изменения в стабильности и динамике многочисленных микробных сообществ были связаны с несколькими заболеваниями, включая диабет типа II, ожирение, жировую болезнь печени, синдром раздраженного кишечника, ВЗК и даже некоторые виды рака. Тем не менее, необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить, увеличивает ли низкое бактериальное разнообразие шансы развития таких заболеваний и метаболических нарушений.

Использование антибиотиков ставит под угрозу защиту генома и увеличивает способность приобретать устойчивость к антибиотикам. Пребиотики, пробиотики, синбиотики, фаговая терапия, системы контроля кворума и системы CRISPR / Cas были предложены в качестве инструментов для контроля и регулирования микробных сообществ. Разработка патоген-специфических бактериофагов и производство фармацевтических препаратов на основе микробиома нашего собственного организма станет возможным и полностью изученным в ближайшем будущем. Использование новых фармацевтических препаратов и нутрицевтиков для регулирования микробной колонизации и развития здорового кишечного микробного сообщества в раннем детстве будет поддерживать функции здорового взрослого человека и предотвращать возникновение ряда заболеваний.

Вклад автора

Авторы провели обзор литературы, критерии оценки и категоризации, а также качество выбранных статей. Авторы прочитали и утвердили окончательную рукопись.

Заявление о конфликте интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Мы благодарим коллег из Института биомедицинских наук Университета Сан-Паулу за идеи и продуктивные обсуждения.Эта работа была поддержана грантами Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP, proc. 2015 / 1177-8, 2015 / 18647-6) и Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).

Сноски

  1. http://www.human-microbiome.org/
  2. http://www.arb-silva.de
  3. http://www.metahit.eu/
  4. http://www.hmpdacc.org/
  5. http://www.genomesonline.org
  6. http: // vmc.vcu.edu/
  7. http://crispr.u-psud.fr/

Список литературы

Aagaard, K., Ma, J., Antony, K.M, Ganu, R., Petrosino, J., and Versalovic, J. (2014). Плацента содержит уникальный микробиом. Sci. Пер. Med. 6: 237ra265. DOI: 10.1126 / scitranslmed.3008599

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Абубукер, С., Сегата, Н., Голл, Дж., Шуберт, А. М., Изард, Дж., Кантарель, Б. Л. и др. (2012). Метаболическая реконструкция метагеномных данных и ее применение к микробиому человека. PLoS Comput. Биол. 8: e1002358. DOI: 10.1371 / journal.pcbi.1002358

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Анукам, К. К., Осазува, Э., Осемене, Г. И., Эгигиагбе, Ф., Брюс, А. В., и Рид, Г. (2006). Клиническое исследование, сравнивающее пробиотик Lactobacillus GR-1 и RC-14 с вагинальным гелем метронидазола для лечения симптоматического бактериального вагиноза. Microbes Infect. 8, 2772–2776. DOI: 10.1016 / j.micinf.2006.08.008

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Арумугам, М., Raes, J., Pelletier, E., Le Paslier, D., Yamada, T., Mende, D.R., et al. (2011). Энтеротипы микробиома кишечника человека. Природа 473, 174–180. DOI: 10.1038 / nature09944

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бэкхед, Ф., Фрейзер, К. М., Рингель, Ю., Сандерс, М. Э., Сартор, Р. Б., Шерман, П. М. и др. (2012). Определение здорового микробиома кишечника человека: современные концепции, будущие направления и клиническое применение. Клеточный микроб-хозяин 12, 611–622.DOI: 10.1016 / j.chom.2012.10.012

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Би, Д., Сюй, З., Харрисон, Э. М., Тай, К., Вэй, Й., Хе, X. и др. (2012). ICEberg: Интернет-ресурс для интегративных и сопряженных элементов, обнаруженных в Bacteria. Nucleic Acids Res. 40, D621 – D626. DOI: 10.1093 / nar / gkr846

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бикард, Д., Цзян, В., Самай, П., Хохшильд, А., Чжан, Ф., и Марраффини, Л.А. (2013). Программируемая репрессия и активация экспрессии бактериальных генов с использованием сконструированной системы CRISPR-Cas. Nucleic Acids Res. 41, 7429–7437. DOI: 10.1093 / nar / gkt520

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Брандт, Л. Дж., И Редди, С. С. (2011). Трансплантация фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . J. Clin. Гастроэнтерол. 45 (Дополнение), S159 – S167. DOI: 10.1097 / MCG.0b013e318222e603

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Браун, К.Т., Шэрон, И.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *